More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6081 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  100 
 
 
259 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0086  ABC taurine transporter, ATPase subunit  81.68 
 
 
264 aa  420  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.445597  normal  0.233394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  76.63 
 
 
265 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  77.43 
 
 
265 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  73.58 
 
 
265 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  73.58 
 
 
265 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  73.58 
 
 
265 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  74.34 
 
 
265 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  73.83 
 
 
265 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  66.93 
 
 
258 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  66.92 
 
 
263 aa  345  5e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2478  ABC transporter related  68.75 
 
 
263 aa  342  5e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133156  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  68.03 
 
 
269 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  64.75 
 
 
262 aa  329  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3845  ABC transporter related  62.21 
 
 
262 aa  323  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  61.75 
 
 
271 aa  314  7e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  60.96 
 
 
271 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  63.35 
 
 
263 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  61.75 
 
 
270 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  60.56 
 
 
270 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0048  ABC transporter for nitrate/sulfonate/bicarbonate ATP-binding protein  54.04 
 
 
279 aa  289  3e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0941519 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  59.26 
 
 
264 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4980  taurine transporter ATP-binding subunit  56.57 
 
 
262 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.525227  normal  0.591838 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  59.34 
 
 
263 aa  280  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5320  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  55.87 
 
 
261 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0256  taurine transporter ATP-binding subunit  55.38 
 
 
262 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  54.98 
 
 
262 aa  275  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0255  taurine transporter ATP-binding subunit  53.44 
 
 
264 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  57.26 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 
260 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0801  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
260 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.119213  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.3 
 
 
260 aa  262  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  52.55 
 
 
255 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  52.55 
 
 
255 aa  260  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  52.55 
 
 
255 aa  260  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4565  taurine transporter ATP-binding subunit  50.2 
 
 
255 aa  259  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.739 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  52.55 
 
 
255 aa  259  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  52.16 
 
 
255 aa  258  5.0000000000000005e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0247  taurine transporter ATP-binding subunit  54.58 
 
 
262 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.09148  normal  0.145394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  52.55 
 
 
255 aa  258  8e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  52.55 
 
 
255 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  52.16 
 
 
255 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  52.55 
 
 
255 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0259  taurine transporter ATP-binding subunit  49.2 
 
 
255 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3937  taurine transporter ATP-binding subunit  49.2 
 
 
255 aa  248  9e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3694  taurine transporter ATP-binding subunit  49.2 
 
 
255 aa  248  9e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1170  taurine ABC transporter ATP-binding protein  52.21 
 
 
263 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0762  ABC transporter related  52 
 
 
278 aa  246  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.289343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12940  taurine ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
263 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.112971  normal  0.32921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3948  ABC transporter related  50 
 
 
268 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000210957  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.25 
 
 
253 aa  237  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  50 
 
 
259 aa  234  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.62 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.99 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.82 
 
 
260 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.24 
 
 
258 aa  230  2e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.46 
 
 
251 aa  229  3e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  46.18 
 
 
271 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
278 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
256 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.68 
 
 
263 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.02 
 
 
254 aa  224  9e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  51.11 
 
 
253 aa  223  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  54.36 
 
 
255 aa  222  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.25 
 
 
254 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.86 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  40.86 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.31 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  51.67 
 
 
283 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  52.94 
 
 
282 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.69 
 
 
301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  48.61 
 
 
252 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.08 
 
 
254 aa  218  7e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.18 
 
 
264 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.7 
 
 
260 aa  218  7e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.68 
 
 
256 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  48.02 
 
 
295 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4569  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  48.44 
 
 
275 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.571931  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  53.77 
 
 
261 aa  217  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  46.4 
 
 
267 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.27 
 
 
261 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.85 
 
 
267 aa  216  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.93 
 
 
277 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.78 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.46 
 
 
272 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  44 
 
 
273 aa  215  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.75 
 
 
259 aa  215  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.37 
 
 
266 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.89 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  53.39 
 
 
257 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.67 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  44.84 
 
 
291 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>