More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6201 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  100 
 
 
245 aa  502  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  52.68 
 
 
274 aa  242  3e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.88 
 
 
286 aa  242  3e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50.21 
 
 
261 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  47.46 
 
 
286 aa  239  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47.68 
 
 
257 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.18 
 
 
259 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
259 aa  237  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  51.35 
 
 
261 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.48 
 
 
254 aa  234  7e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1294  ABC transporter related  51.75 
 
 
262 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.195948  normal  0.376789 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  49.78 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.47 
 
 
259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.06 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.5 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.33 
 
 
279 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.68 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 
252 aa  232  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.9 
 
 
267 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2000  ABC transporter related  51.32 
 
 
262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  48.35 
 
 
264 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.4 
 
 
254 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.59 
 
 
264 aa  232  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6101  ABC transporter related  51.32 
 
 
262 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1976  ABC transporter related  51.32 
 
 
262 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.227551  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  49.55 
 
 
260 aa  231  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  47.72 
 
 
267 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.35 
 
 
253 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.91 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.84 
 
 
282 aa  230  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.47 
 
 
259 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  49.36 
 
 
278 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.48 
 
 
283 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.29 
 
 
267 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
256 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  47.16 
 
 
267 aa  228  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.64 
 
 
262 aa  228  6e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.11 
 
 
259 aa  228  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
264 aa  228  8e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 
259 aa  228  9e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.34 
 
 
261 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
253 aa  227  2e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  48.73 
 
 
263 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  50 
 
 
264 aa  226  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  46.28 
 
 
259 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
260 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  225  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.77 
 
 
260 aa  226  4e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50.49 
 
 
297 aa  225  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  225  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
272 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.81 
 
 
252 aa  224  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.37 
 
 
258 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  46.34 
 
 
257 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  49.12 
 
 
293 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.76 
 
 
263 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.24 
 
 
280 aa  222  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.77 
 
 
272 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  48.67 
 
 
293 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.9 
 
 
269 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  48.18 
 
 
276 aa  221  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.92 
 
 
255 aa  221  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  51.98 
 
 
301 aa  221  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.02 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.78 
 
 
307 aa  220  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.79 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  50.98 
 
 
271 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.74 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.25 
 
 
261 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  53.54 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.12 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  48.7 
 
 
290 aa  219  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  49.03 
 
 
278 aa  219  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.38 
 
 
304 aa  219  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  46.38 
 
 
270 aa  219  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 
271 aa  219  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.4 
 
 
283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  44.83 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.9 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  53.23 
 
 
265 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.35 
 
 
304 aa  218  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  43.04 
 
 
251 aa  218  7e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  45.38 
 
 
306 aa  218  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.7 
 
 
253 aa  218  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.88 
 
 
256 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  48.23 
 
 
283 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.35 
 
 
303 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.35 
 
 
303 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  217  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  51.33 
 
 
288 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  52.48 
 
 
265 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.35 
 
 
303 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  51.96 
 
 
263 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
278 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  44.35 
 
 
270 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  49.07 
 
 
255 aa  216  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  43.72 
 
 
258 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.34 
 
 
268 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>