More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1075 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  62.8 
 
 		 253 aa  330  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  59.84 
 
 		 253 aa  322  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  60.82 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  57.96 
 
 		 263 aa  317  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  58.75 
 
 		 251 aa  310  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  51.43 
 
 		 258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.25 
 
 		 252 aa  284  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  54.94 
 
 		 297 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  51.67 
 
 		 254 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  53.78 
 
 		 263 aa  281  5.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  52.08 
 
 		 254 aa  281  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  52.08 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  51.67 
 
 		 254 aa  278  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  56.65 
 
 		 254 aa  275  4e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  52.44 
 
 		 269 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  51.46 
 
 		 264 aa  272  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  54.69 
 
 		 257 aa  270  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.39 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 256 aa  266  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  50.21 
 
 		 256 aa  265  5.999999999999999e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.69 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  262  4.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.2 
 
 		 280 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  54.59 
 
 		 282 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  51.23 
 
 		 258 aa  261  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.6 
 
 		 274 aa  261  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  54.08 
 
 		 283 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 272 aa  259  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  52.84 
 
 		 261 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48 
 
 		 272 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.2 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  53.25 
 
 		 292 aa  258  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  55.14 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.59 
 
 		 264 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  54.22 
 
 		 307 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.8 
 
 		 278 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  50.62 
 
 		 289 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  51.45 
 
 		 287 aa  255  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  49.15 
 
 		 279 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  52.3 
 
 		 272 aa  255  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.2 
 
 		 304 aa  255  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  49 
 
 		 263 aa  255  6e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  51.63 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.79 
 
 		 273 aa  255  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.8 
 
 		 304 aa  255  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  49.62 
 
 		 295 aa  254  7e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  51.45 
 
 		 293 aa  254  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.22 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  51.45 
 
 		 293 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  46.54 
 
 		 284 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50.6 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  51.71 
 
 		 273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.2 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 308 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.22 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  52.79 
 
 		 285 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50.2 
 
 		 259 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  50.2 
 
 		 303 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  50.2 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  50.2 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  50.21 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.79 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 261 aa  249  4e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  52.3 
 
 		 290 aa  248  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.63 
 
 		 272 aa  248  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.7 
 
 		 259 aa  248  9e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52.17 
 
 		 274 aa  248  9e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  49.8 
 
 		 258 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.65 
 
 		 267 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  50.86 
 
 		 257 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  52.42 
 
 		 315 aa  246  3e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  47.08 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  47.62 
 
 		 258 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 260 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.22 
 
 		 279 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  47.93 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  46.75 
 
 		 273 aa  242  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.65 
 
 		 291 aa  242  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  47.76 
 
 		 259 aa  241  6e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  47.08 
 
 		 260 aa  241  6e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 267 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.28 
 
 		 259 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  46.59 
 
 		 278 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 		 256 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  49.78 
 
 		 286 aa  240  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 278 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  46.8 
 
 		 267 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  46.8 
 
 		 286 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  47.35 
 
 		 262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  46.91 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  49.6 
 
 		 258 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  46.86 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  50.88 
 
 		 269 aa  237  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  48.12 
 
 		 260 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>