More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0572 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  52.23 
 
 
252 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  55.75 
 
 
251 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.8 
 
 
253 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
252 aa  259  3e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.18 
 
 
260 aa  258  8e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.56 
 
 
258 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.99 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.36 
 
 
263 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
254 aa  251  1e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.33 
 
 
274 aa  249  4e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.51 
 
 
274 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.57 
 
 
272 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.59 
 
 
267 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.77 
 
 
253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48 
 
 
307 aa  245  6e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.98 
 
 
253 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50.67 
 
 
272 aa  242  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.56 
 
 
254 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.56 
 
 
254 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.96 
 
 
254 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.8 
 
 
267 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  49.4 
 
 
297 aa  237  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  51.09 
 
 
259 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.34 
 
 
279 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.24 
 
 
258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  49.15 
 
 
303 aa  235  7e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
308 aa  234  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.25 
 
 
261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.59 
 
 
293 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48 
 
 
306 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.67 
 
 
289 aa  232  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 
275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.03 
 
 
272 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.59 
 
 
293 aa  232  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.11 
 
 
246 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.18 
 
 
281 aa  231  1e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
272 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.13 
 
 
278 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  53.57 
 
 
280 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  49.04 
 
 
283 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  47.95 
 
 
281 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  49.35 
 
 
259 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 
272 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.95 
 
 
271 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  46.46 
 
 
281 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  46.46 
 
 
281 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  46.99 
 
 
281 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.88 
 
 
260 aa  229  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.6 
 
 
304 aa  229  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.97 
 
 
284 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.01 
 
 
287 aa  228  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  45.31 
 
 
273 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.94 
 
 
264 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.35 
 
 
261 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.58 
 
 
261 aa  227  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  47.92 
 
 
265 aa  227  1e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.62 
 
 
263 aa  227  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
261 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.27 
 
 
272 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3513  ABC transporter related  44.4 
 
 
279 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.09 
 
 
256 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  47.9 
 
 
267 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  43.82 
 
 
457 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.94 
 
 
264 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.75 
 
 
303 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.54 
 
 
281 aa  226  4e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  53.85 
 
 
269 aa  226  4e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.75 
 
 
303 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.75 
 
 
303 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.22 
 
 
271 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.75 
 
 
304 aa  225  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
258 aa  225  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.88 
 
 
264 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.75 
 
 
304 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.77 
 
 
256 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.84 
 
 
282 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
271 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.85 
 
 
315 aa  223  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  43.6 
 
 
457 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  43.75 
 
 
275 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.37 
 
 
278 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 
281 aa  222  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.15 
 
 
264 aa  222  4e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.88 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.99 
 
 
259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  44.4 
 
 
448 aa  221  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  43.72 
 
 
249 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  43.03 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.97 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  48.7 
 
 
270 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  43.8 
 
 
445 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.21 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  48.02 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  42.52 
 
 
445 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.17 
 
 
251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.76 
 
 
286 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.44 
 
 
288 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  44.9 
 
 
267 aa  218  6e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>