More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1210 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  100 
 
 
287 aa  579  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  89.42 
 
 
293 aa  530  1e-149  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  89.08 
 
 
293 aa  529  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  83.74 
 
 
289 aa  491  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  74.61 
 
 
263 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  72.45 
 
 
271 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  72.45 
 
 
271 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  72.45 
 
 
271 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  70.88 
 
 
267 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  68.87 
 
 
272 aa  372  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  71.65 
 
 
267 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  68.87 
 
 
272 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  68.87 
 
 
272 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  70.77 
 
 
272 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  53.6 
 
 
272 aa  285  4e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  51.85 
 
 
272 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  54.23 
 
 
283 aa  269  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  52.82 
 
 
260 aa  261  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  53.01 
 
 
253 aa  260  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  50.8 
 
 
259 aa  259  3e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.06 
 
 
291 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.21 
 
 
251 aa  257  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  53.22 
 
 
260 aa  256  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.57 
 
 
259 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  51.45 
 
 
252 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
252 aa  256  3e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  54.24 
 
 
260 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  52.02 
 
 
259 aa  254  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.37 
 
 
264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  48.15 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.44 
 
 
269 aa  253  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.89 
 
 
258 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  50.85 
 
 
273 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  47.83 
 
 
279 aa  251  8.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  55 
 
 
280 aa  250  2e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  50.65 
 
 
254 aa  249  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.07 
 
 
297 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  50.22 
 
 
254 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
261 aa  248  6e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
254 aa  248  8e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.38 
 
 
306 aa  247  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
267 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
256 aa  248  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.42 
 
 
264 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.22 
 
 
254 aa  246  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  49 
 
 
261 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.42 
 
 
274 aa  246  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.07 
 
 
292 aa  245  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.72 
 
 
253 aa  244  8e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  52.74 
 
 
255 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.64 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  51.07 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  49.2 
 
 
259 aa  242  5e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.39 
 
 
264 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.59 
 
 
303 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  49.15 
 
 
263 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
261 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
308 aa  240  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  50.21 
 
 
286 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.64 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.18 
 
 
303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  46.18 
 
 
257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.01 
 
 
257 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.71 
 
 
256 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.91 
 
 
307 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.66 
 
 
263 aa  239  5e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  49.6 
 
 
259 aa  238  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.39 
 
 
259 aa  238  6.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  48.03 
 
 
286 aa  238  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  49.19 
 
 
278 aa  238  8e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
311 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  47.28 
 
 
265 aa  238  9e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
290 aa  237  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.09 
 
 
281 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  51.3 
 
 
278 aa  237  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50.64 
 
 
258 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  51.26 
 
 
311 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  49.56 
 
 
257 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  48.58 
 
 
253 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  48.8 
 
 
261 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  44.49 
 
 
258 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05590  hypothetical protein  50.22 
 
 
278 aa  236  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.2 
 
 
267 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  50.21 
 
 
282 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  51.71 
 
 
266 aa  235  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.88 
 
 
284 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001609  nitrate ABC transporter ATP-binding protein  50.45 
 
 
278 aa  235  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  49.58 
 
 
313 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.21 
 
 
268 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  45.2 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  45.11 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  48.79 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.41 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49 
 
 
259 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.79 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  54.81 
 
 
288 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  48.44 
 
 
264 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.32 
 
 
304 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0275  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.64 
 
 
267 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.219358 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>