More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_5062 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  57.5 
 
 
253 aa  294  1e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  58.05 
 
 
254 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  52.67 
 
 
253 aa  279  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  56.17 
 
 
251 aa  276  2e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  53.94 
 
 
260 aa  275  4e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  54.32 
 
 
263 aa  274  8e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  51.03 
 
 
254 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  50.62 
 
 
258 aa  270  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.99 
 
 
252 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  51.44 
 
 
254 aa  265  5.999999999999999e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  51.03 
 
 
254 aa  263  2e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  52.07 
 
 
306 aa  263  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.79 
 
 
252 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  50.62 
 
 
254 aa  261  8e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.77 
 
 
264 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.19 
 
 
265 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.87 
 
 
284 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.77 
 
 
263 aa  254  7e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  51.03 
 
 
308 aa  252  3e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  49.39 
 
 
259 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.08 
 
 
256 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  52.44 
 
 
307 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  49.59 
 
 
278 aa  249  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.91 
 
 
297 aa  249  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  47.54 
 
 
256 aa  248  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.5 
 
 
267 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  51.04 
 
 
259 aa  248  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  53.27 
 
 
288 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  50 
 
 
303 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.18 
 
 
304 aa  246  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.59 
 
 
303 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.59 
 
 
303 aa  246  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  52 
 
 
274 aa  246  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.59 
 
 
304 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.29 
 
 
292 aa  244  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  53.57 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  48.77 
 
 
281 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.16 
 
 
281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.77 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  49.37 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  53.1 
 
 
261 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  48.36 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  48.36 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  50 
 
 
281 aa  241  7e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.38 
 
 
278 aa  241  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  48.95 
 
 
288 aa  240  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  49.17 
 
 
284 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.38 
 
 
280 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.67 
 
 
279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.88 
 
 
274 aa  239  4e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  52.91 
 
 
264 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.59 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.22 
 
 
278 aa  238  8e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.75 
 
 
311 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.72 
 
 
260 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.96 
 
 
286 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  48.56 
 
 
260 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.92 
 
 
311 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  48.29 
 
 
252 aa  237  2e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  48.78 
 
 
284 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.76 
 
 
259 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.72 
 
 
259 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
260 aa  235  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  48.55 
 
 
262 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  51.06 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  48.93 
 
 
266 aa  234  7e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.12 
 
 
285 aa  234  7e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.96 
 
 
278 aa  234  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  48.12 
 
 
259 aa  234  9e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 
281 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  51.27 
 
 
295 aa  233  3e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
247 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  48.57 
 
 
258 aa  233  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0522  ABC transporter related  47.72 
 
 
249 aa  232  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.351686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.59 
 
 
261 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.39 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  46.12 
 
 
259 aa  232  5e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  49.34 
 
 
258 aa  232  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.15 
 
 
330 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  51.89 
 
 
290 aa  231  7.000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.18 
 
 
257 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  49.33 
 
 
272 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
291 aa  231  9e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.37 
 
 
272 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  47.08 
 
 
269 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.33 
 
 
281 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  48.91 
 
 
287 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  50.22 
 
 
273 aa  231  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  47.92 
 
 
311 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  54.46 
 
 
301 aa  229  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  48.89 
 
 
272 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  47.52 
 
 
260 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.9 
 
 
265 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  47.9 
 
 
269 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
261 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  47.56 
 
 
285 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  50 
 
 
272 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  45.68 
 
 
266 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>