More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1831 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  100 
 
 
266 aa  537  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  95.04 
 
 
269 aa  501  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  81.1 
 
 
267 aa  420  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  78.24 
 
 
262 aa  410  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  64.92 
 
 
271 aa  323  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  62.02 
 
 
287 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  59.92 
 
 
269 aa  310  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  62.7 
 
 
287 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 
279 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  60 
 
 
269 aa  297  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  60.26 
 
 
252 aa  287  2e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  55.83 
 
 
265 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  57.69 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.63 
 
 
284 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  54.55 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  57.32 
 
 
286 aa  271  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  54.94 
 
 
288 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  53.85 
 
 
285 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  57.59 
 
 
261 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  57.2 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  56.78 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  56.78 
 
 
281 aa  267  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  55.93 
 
 
281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.26 
 
 
281 aa  263  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  55.93 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  56.12 
 
 
255 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  52.48 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  52.24 
 
 
291 aa  251  7e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  53.39 
 
 
260 aa  251  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  57.67 
 
 
276 aa  251  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  51.65 
 
 
256 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  51.52 
 
 
267 aa  246  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
261 aa  245  6e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4216  ABC transporter related  52.48 
 
 
256 aa  242  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  53.54 
 
 
278 aa  242  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  47.81 
 
 
262 aa  241  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  51 
 
 
286 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4059  ABC transporter related  47.11 
 
 
276 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.86 
 
 
258 aa  236  3e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  50.92 
 
 
267 aa  236  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.78 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  45.67 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  50 
 
 
263 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  49.17 
 
 
256 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.84 
 
 
254 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  45.57 
 
 
255 aa  230  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.59 
 
 
253 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.41 
 
 
254 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  49.58 
 
 
272 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.68 
 
 
246 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  50 
 
 
263 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  50.66 
 
 
259 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.71 
 
 
263 aa  228  8e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.84 
 
 
254 aa  227  1e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
251 aa  227  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.78 
 
 
274 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
260 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.06 
 
 
251 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.93 
 
 
304 aa  226  4e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
256 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.82 
 
 
262 aa  225  7e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
251 aa  225  7e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  52.07 
 
 
245 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  50.98 
 
 
261 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  48.78 
 
 
267 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  42.49 
 
 
251 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  49.79 
 
 
264 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.1 
 
 
254 aa  223  2e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  45.23 
 
 
257 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 
287 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.49 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  42.49 
 
 
251 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.91 
 
 
267 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  45.38 
 
 
271 aa  222  4e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.53 
 
 
272 aa  222  4e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  45.1 
 
 
293 aa  222  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.12 
 
 
263 aa  222  6e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.63 
 
 
251 aa  221  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  45.1 
 
 
293 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
267 aa  221  9e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.06 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.26 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  51.67 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  48.07 
 
 
268 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45 
 
 
260 aa  219  3e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  49.29 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.24 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  49.56 
 
 
266 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.69 
 
 
264 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.21 
 
 
258 aa  218  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.03 
 
 
258 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  44.16 
 
 
303 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.58 
 
 
259 aa  217  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  47.13 
 
 
308 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.58 
 
 
252 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50.68 
 
 
265 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>