More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2775 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  100 
 
 
268 aa  534  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  72.8 
 
 
266 aa  358  5e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  70.4 
 
 
263 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  68.73 
 
 
280 aa  355  2.9999999999999997e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  72.4 
 
 
266 aa  355  5e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  70 
 
 
264 aa  354  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1759  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  71.6 
 
 
275 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.352483  hitchhiker  0.00557552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  67.42 
 
 
262 aa  353  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  69.72 
 
 
263 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  72 
 
 
273 aa  351  8e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  68.46 
 
 
265 aa  351  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  68.94 
 
 
276 aa  350  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  72 
 
 
273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  72 
 
 
273 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  71.6 
 
 
271 aa  349  3e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  70.4 
 
 
262 aa  346  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  67.42 
 
 
276 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  68.8 
 
 
265 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  68.8 
 
 
265 aa  343  2e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1167  ABC transporter related  70.47 
 
 
266 aa  330  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.174224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1327  ABC transporter related  70.47 
 
 
266 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.193146  normal  0.338067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31130  ABC transporter ATP binding protein  66.16 
 
 
264 aa  328  8e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.098287  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4837  ABC transporter related  71.84 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.856491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  60.98 
 
 
270 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4901  ABC transporter related  70.61 
 
 
265 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5619  ABC transporter related  70.73 
 
 
278 aa  324  9e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.406047 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  65.6 
 
 
263 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0859  ABC transporter related  59.46 
 
 
258 aa  278  8e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0340597  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.63 
 
 
258 aa  248  7e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  48.4 
 
 
262 aa  247  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.7 
 
 
284 aa  247  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.7 
 
 
251 aa  245  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  48.35 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
267 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.11 
 
 
263 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.92 
 
 
258 aa  235  7e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50.88 
 
 
261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  49.4 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.81 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.09 
 
 
253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  48.76 
 
 
259 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.17 
 
 
265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.91 
 
 
254 aa  231  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.56 
 
 
259 aa  231  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.83 
 
 
259 aa  231  9e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
259 aa  230  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
256 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  49.8 
 
 
271 aa  230  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.94 
 
 
252 aa  230  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.3 
 
 
253 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.76 
 
 
259 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  48.56 
 
 
260 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  48.79 
 
 
286 aa  228  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
252 aa  227  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.39 
 
 
285 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  50.63 
 
 
255 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  48.99 
 
 
259 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  48.67 
 
 
261 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  49.79 
 
 
264 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  47.98 
 
 
287 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  47.62 
 
 
282 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.72 
 
 
246 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.46 
 
 
260 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  45.45 
 
 
278 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.15 
 
 
281 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.37 
 
 
262 aa  223  3e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  49.37 
 
 
267 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  43.93 
 
 
265 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.21 
 
 
281 aa  222  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  49.12 
 
 
274 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  45.53 
 
 
247 aa  222  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  49.58 
 
 
281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  48.75 
 
 
298 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.3 
 
 
283 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  45.38 
 
 
259 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  49.79 
 
 
281 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  45.45 
 
 
256 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  46.59 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  49.58 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.79 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.79 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.4 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.59 
 
 
254 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  42.64 
 
 
289 aa  219  3e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
251 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  50.2 
 
 
279 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.76 
 
 
256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  45.45 
 
 
256 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.85 
 
 
263 aa  218  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  45.93 
 
 
438 aa  218  7e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0518  ABC transporter related  44.18 
 
 
251 aa  218  7e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0668651 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.9 
 
 
262 aa  218  7.999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  46.09 
 
 
285 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.14 
 
 
293 aa  217  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  43.33 
 
 
287 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  45.93 
 
 
434 aa  218  1e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  47.18 
 
 
287 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.56 
 
 
265 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  42.08 
 
 
293 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>