More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0748 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0748  ABC transporter related  100 
 
 
261 aa  510  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.539344 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  57.14 
 
 
265 aa  288  9e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  58.5 
 
 
276 aa  284  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  59.67 
 
 
285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  61.16 
 
 
281 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  61.16 
 
 
281 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  60.33 
 
 
281 aa  275  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  59.27 
 
 
281 aa  275  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  59.04 
 
 
288 aa  275  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  59.09 
 
 
286 aa  275  6e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.74 
 
 
281 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  57.83 
 
 
298 aa  271  9e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  59.92 
 
 
281 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  55.65 
 
 
261 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
255 aa  266  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.85 
 
 
284 aa  265  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  57.26 
 
 
260 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  57.74 
 
 
278 aa  257  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  54.32 
 
 
262 aa  255  4e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  53.91 
 
 
271 aa  254  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  54.84 
 
 
287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  56.33 
 
 
259 aa  253  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  52.76 
 
 
279 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  54.1 
 
 
269 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3882  ABC transporter related  51.25 
 
 
259 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  54.13 
 
 
279 aa  249  3e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  56.67 
 
 
291 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  53.94 
 
 
287 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  51.92 
 
 
267 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  51.6 
 
 
269 aa  244  8e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  50.98 
 
 
266 aa  240  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  52.05 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  51.79 
 
 
262 aa  238  9e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  49.36 
 
 
255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0238  ABC sulfate ester transporter, ATPase subunit  55.95 
 
 
286 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81925  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.58 
 
 
251 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
251 aa  231  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.62 
 
 
256 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  47.48 
 
 
255 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  45.19 
 
 
256 aa  229  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  50.63 
 
 
252 aa  228  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  45 
 
 
251 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  50.21 
 
 
247 aa  228  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
287 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.88 
 
 
292 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 
251 aa  227  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  52.02 
 
 
263 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  44.58 
 
 
251 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.48 
 
 
258 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.67 
 
 
251 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49 
 
 
259 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.33 
 
 
246 aa  222  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.67 
 
 
263 aa  222  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.67 
 
 
251 aa  222  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.83 
 
 
264 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.83 
 
 
304 aa  221  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  50.2 
 
 
256 aa  221  6e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  47.18 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  50.41 
 
 
260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  50.39 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.83 
 
 
307 aa  218  8.999999999999998e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.59 
 
 
276 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  48.22 
 
 
271 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
308 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.94 
 
 
304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1024  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.85 
 
 
288 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0928841 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6389  ABC transporter related  49.59 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350257  normal  0.506492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  49.34 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.03 
 
 
251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0039  ABC transporter related  46.99 
 
 
276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147558  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.59 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.12 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.09 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.24 
 
 
303 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  48.48 
 
 
263 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  50.6 
 
 
270 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.27 
 
 
280 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.23 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.41 
 
 
258 aa  211  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.91 
 
 
263 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.84 
 
 
303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.84 
 
 
303 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4539  ABC transporter related  48.35 
 
 
256 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.37 
 
 
290 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.5 
 
 
252 aa  210  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  54.46 
 
 
288 aa  208  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
260 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.19 
 
 
263 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  49.59 
 
 
280 aa  209  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.54 
 
 
259 aa  208  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
267 aa  208  7e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  48.39 
 
 
263 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  50.2 
 
 
262 aa  208  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.64 
 
 
278 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.11 
 
 
274 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.33 
 
 
278 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  47.76 
 
 
257 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>