More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1321 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  100 
 
 
288 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  63.31 
 
 
262 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
261 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  54.91 
 
 
287 aa  240  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  53.6 
 
 
278 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  50.41 
 
 
265 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  60 
 
 
292 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  53.05 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 
264 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  50.62 
 
 
264 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.79 
 
 
293 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  52.23 
 
 
293 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.44 
 
 
261 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
257 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  52.34 
 
 
263 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  52.65 
 
 
289 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.61 
 
 
278 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  48.33 
 
 
251 aa  226  3e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  44.53 
 
 
308 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  46.96 
 
 
260 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  51.33 
 
 
245 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  55.78 
 
 
283 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  52.7 
 
 
268 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  53.27 
 
 
265 aa  223  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.87 
 
 
262 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.41 
 
 
273 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  46.03 
 
 
303 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  54.26 
 
 
253 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.12 
 
 
251 aa  223  3e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.74 
 
 
263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.12 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  51.69 
 
 
257 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.22 
 
 
289 aa  222  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  53.61 
 
 
258 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.68 
 
 
260 aa  221  7e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.64 
 
 
264 aa  221  8e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.96 
 
 
263 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.93 
 
 
261 aa  221  8e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.25 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.38 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  48.21 
 
 
256 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  50.59 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.57 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.84 
 
 
280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.28 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  51.75 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  52.32 
 
 
263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.9 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  49 
 
 
255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  51.19 
 
 
260 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  50.42 
 
 
262 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  46.36 
 
 
266 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.13 
 
 
254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.43 
 
 
304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.07 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  45.27 
 
 
255 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  48.83 
 
 
265 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  48.47 
 
 
315 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.2 
 
 
272 aa  218  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
255 aa  218  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  51.12 
 
 
278 aa  218  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  47.06 
 
 
272 aa  218  7.999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 
272 aa  218  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.9 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.79 
 
 
274 aa  218  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  50.97 
 
 
265 aa  217  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  49.35 
 
 
270 aa  218  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  51.14 
 
 
286 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  48.25 
 
 
267 aa  217  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.13 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.91 
 
 
269 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.53 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.37 
 
 
259 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  48.29 
 
 
259 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  43.95 
 
 
273 aa  217  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  54.98 
 
 
267 aa  217  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.35 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  51.01 
 
 
280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  51.9 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  51.57 
 
 
265 aa  216  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  48.77 
 
 
285 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  49.57 
 
 
304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.96 
 
 
281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  50.49 
 
 
277 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  53.81 
 
 
262 aa  215  7e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  56.63 
 
 
264 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  50.47 
 
 
256 aa  215  7e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.48 
 
 
279 aa  215  8e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  51.3 
 
 
263 aa  215  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
285 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
281 aa  215  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  49.77 
 
 
259 aa  215  8e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  50 
 
 
285 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.56 
 
 
263 aa  215  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.21 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.28 
 
 
253 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.03 
 
 
306 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>