More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2333 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  62.84 
 
 
290 aa  334  7e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  63.64 
 
 
267 aa  330  1e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  61.85 
 
 
263 aa  319  3e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  57.43 
 
 
261 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  57.03 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  57.79 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  54.94 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  54.94 
 
 
262 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  62.2 
 
 
294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  55.24 
 
 
259 aa  281  8.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.8 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 
253 aa  229  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 
267 aa  225  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.97 
 
 
304 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.89 
 
 
254 aa  224  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  51.2 
 
 
278 aa  224  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.25 
 
 
258 aa  224  8e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.53 
 
 
308 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  45.45 
 
 
261 aa  224  1e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  50.65 
 
 
260 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.01 
 
 
304 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  47.58 
 
 
255 aa  222  4e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.14 
 
 
266 aa  221  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.42 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.19 
 
 
261 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  50.43 
 
 
288 aa  220  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  50.47 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46.27 
 
 
306 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.06 
 
 
271 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.29 
 
 
256 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  48.45 
 
 
303 aa  218  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 
271 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.42 
 
 
259 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  45.6 
 
 
286 aa  217  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  48.62 
 
 
303 aa  217  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.58 
 
 
251 aa  217  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.66 
 
 
271 aa  216  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  43.25 
 
 
259 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.47 
 
 
291 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.88 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  48.22 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.21 
 
 
274 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  42.34 
 
 
303 aa  216  4e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.82 
 
 
260 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.44 
 
 
297 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.04 
 
 
285 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.38 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.86 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.66 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.96 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  43.58 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.78 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  43.7 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  46.75 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  44.27 
 
 
304 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
251 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  47.22 
 
 
268 aa  211  7e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  44.27 
 
 
264 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.57 
 
 
251 aa  211  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.37 
 
 
267 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.97 
 
 
259 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.85 
 
 
258 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 
259 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  40.65 
 
 
273 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.41 
 
 
271 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.77 
 
 
276 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  44.73 
 
 
261 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.41 
 
 
264 aa  209  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.95 
 
 
307 aa  209  3e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.49 
 
 
253 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.97 
 
 
254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  51.19 
 
 
288 aa  209  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 
276 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
267 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  48.47 
 
 
265 aa  209  4e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.76 
 
 
254 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  46.98 
 
 
251 aa  209  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.89 
 
 
267 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  44.22 
 
 
272 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  48.75 
 
 
275 aa  208  6e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  46.31 
 
 
293 aa  208  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.56 
 
 
281 aa  208  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  44.71 
 
 
269 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.23 
 
 
263 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  48.02 
 
 
265 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.42 
 
 
273 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.71 
 
 
261 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  42.13 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  47.11 
 
 
256 aa  207  1e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21980  ABC transporter, ATP binding component  46.03 
 
 
271 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  42.74 
 
 
271 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.31 
 
 
274 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  42.91 
 
 
286 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.97 
 
 
254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0767  ABC transporter related  45 
 
 
265 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  41.39 
 
 
256 aa  206  3e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>