More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0408 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  533  1e-150  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  60.82 
 
 
265 aa  295  5e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0997  ABC transporter-related protein  52.02 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.929403 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  48.99 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  48.77 
 
 
279 aa  243  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.36 
 
 
251 aa  237  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.36 
 
 
265 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.72 
 
 
260 aa  234  8e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.17 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  52.05 
 
 
262 aa  232  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  50.2 
 
 
311 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.35 
 
 
304 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  49.4 
 
 
311 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
252 aa  228  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.59 
 
 
246 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.38 
 
 
272 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  50.21 
 
 
313 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
308 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  49.4 
 
 
311 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  47.64 
 
 
265 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  48.13 
 
 
265 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.35 
 
 
307 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.46 
 
 
261 aa  223  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  51.33 
 
 
306 aa  223  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  49.58 
 
 
260 aa  222  4.9999999999999996e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
256 aa  221  7e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  47.72 
 
 
265 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  47.72 
 
 
265 aa  221  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  52.61 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.93 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.31 
 
 
263 aa  219  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  49.59 
 
 
297 aa  219  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  48.95 
 
 
265 aa  219  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  48.37 
 
 
263 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.5 
 
 
257 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  47.3 
 
 
265 aa  219  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.74 
 
 
304 aa  218  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  52.59 
 
 
263 aa  218  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.74 
 
 
304 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  51.49 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  46.44 
 
 
271 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.93 
 
 
272 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.56 
 
 
287 aa  217  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  46.38 
 
 
283 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  48.93 
 
 
259 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 
264 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.99 
 
 
259 aa  215  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.09 
 
 
258 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.91 
 
 
272 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  50 
 
 
253 aa  216  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.04 
 
 
254 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
278 aa  215  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.6 
 
 
284 aa  215  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  47.5 
 
 
271 aa  214  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  52.8 
 
 
290 aa  214  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  43.72 
 
 
261 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.27 
 
 
263 aa  214  9.999999999999999e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.88 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.09 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.09 
 
 
293 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.31 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.6 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.44 
 
 
262 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.93 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.61 
 
 
278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  44.8 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.31 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.93 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  48.18 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  47.93 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.21 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.83 
 
 
254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  50.42 
 
 
288 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 
265 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  46.06 
 
 
287 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  48.23 
 
 
258 aa  211  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.81 
 
 
289 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  47.64 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.25 
 
 
260 aa  211  7.999999999999999e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  46.47 
 
 
287 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.99 
 
 
252 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.52 
 
 
263 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.78 
 
 
253 aa  210  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.39 
 
 
258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.42 
 
 
271 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.18 
 
 
284 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.44 
 
 
257 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.7 
 
 
276 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.21 
 
 
267 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  46.67 
 
 
271 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  46.44 
 
 
270 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  42.28 
 
 
254 aa  209  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.47 
 
 
271 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  47.37 
 
 
253 aa  209  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  46.91 
 
 
265 aa  209  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6081  ABC transporter related  45.97 
 
 
259 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.200022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5413  putative nitrate ABC transporter ATP-binding protein (ntrC/D-like protein)  46.81 
 
 
300 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>