More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7381 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  66.53 
 
 
297 aa  308  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  64.88 
 
 
241 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  64.05 
 
 
241 aa  301  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  64.71 
 
 
265 aa  298  6e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  56.6 
 
 
265 aa  288  5.0000000000000004e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  61.9 
 
 
272 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 
263 aa  287  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  59.59 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  64.46 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1233  ABC transporter related  60.52 
 
 
262 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  52.05 
 
 
262 aa  232  5e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  49.8 
 
 
289 aa  227  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.21 
 
 
293 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 
273 aa  226  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  50.21 
 
 
293 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  48.24 
 
 
271 aa  221  7e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.82 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
271 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.59 
 
 
255 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.45 
 
 
271 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.67 
 
 
287 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.43 
 
 
279 aa  215  5.9999999999999996e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  49.79 
 
 
292 aa  212  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.53 
 
 
263 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.22 
 
 
272 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  42.91 
 
 
284 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.75 
 
 
272 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.08 
 
 
260 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.19 
 
 
261 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.27 
 
 
264 aa  205  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.61 
 
 
264 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  47.77 
 
 
313 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.7 
 
 
253 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.09 
 
 
261 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.36 
 
 
267 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  49.79 
 
 
273 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  43.59 
 
 
254 aa  202  4e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 
311 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  48.25 
 
 
257 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  48.89 
 
 
265 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.3 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.78 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  45.18 
 
 
272 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.85 
 
 
258 aa  198  7e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.18 
 
 
272 aa  198  9e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  47.13 
 
 
311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  41.2 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.24 
 
 
330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  40.8 
 
 
259 aa  196  3e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.99 
 
 
260 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.25 
 
 
252 aa  196  3e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 
256 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0155  ABC transporter related protein  39.92 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  47.92 
 
 
273 aa  195  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.75 
 
 
280 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.29 
 
 
254 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 
264 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.61 
 
 
268 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.57 
 
 
267 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  40.8 
 
 
259 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  46.15 
 
 
276 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.42 
 
 
285 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  43.7 
 
 
251 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  43.44 
 
 
258 aa  193  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.45 
 
 
271 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  46.89 
 
 
304 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.95 
 
 
284 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.73 
 
 
261 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  45.45 
 
 
261 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.99 
 
 
259 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.96 
 
 
263 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  44.68 
 
 
239 aa  193  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.31 
 
 
274 aa  192  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
265 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  43.43 
 
 
259 aa  192  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.96 
 
 
262 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  38.1 
 
 
258 aa  191  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  45.71 
 
 
270 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.02 
 
 
270 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
440 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.09 
 
 
261 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.63 
 
 
259 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.34 
 
 
260 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
291 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.95 
 
 
324 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  48.71 
 
 
298 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.6 
 
 
253 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.87 
 
 
278 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.98 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.96 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.49 
 
 
263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.9 
 
 
278 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.36 
 
 
254 aa  189  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.78 
 
 
281 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  48.66 
 
 
259 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42 
 
 
259 aa  189  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>