More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4138 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  100 
 
 
311 aa  605  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  98.07 
 
 
311 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  93.25 
 
 
311 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  78.02 
 
 
313 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  52.05 
 
 
273 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.45 
 
 
279 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  51.03 
 
 
289 aa  250  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  51.28 
 
 
263 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  50 
 
 
259 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  49.39 
 
 
264 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  55.83 
 
 
251 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.27 
 
 
254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  53.81 
 
 
257 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  50.81 
 
 
293 aa  239  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  51.09 
 
 
286 aa  239  5e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.37 
 
 
260 aa  239  5e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  51.26 
 
 
293 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.28 
 
 
280 aa  238  8e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  54.02 
 
 
282 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  53.39 
 
 
287 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  45.86 
 
 
292 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  52.14 
 
 
271 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  47.31 
 
 
265 aa  236  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 
271 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.92 
 
 
246 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  49.39 
 
 
265 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  50.61 
 
 
267 aa  236  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  50.63 
 
 
272 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50 
 
 
260 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  52.14 
 
 
271 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.39 
 
 
279 aa  235  6e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  56.94 
 
 
264 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  50 
 
 
253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.1 
 
 
258 aa  233  3e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  53.4 
 
 
254 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  53.1 
 
 
274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.27 
 
 
254 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  50.42 
 
 
258 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  47.62 
 
 
275 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.27 
 
 
281 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  49.36 
 
 
286 aa  232  5e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
308 aa  232  6e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  50.42 
 
 
291 aa  232  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.27 
 
 
254 aa  232  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  53.1 
 
 
267 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
261 aa  232  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  51.56 
 
 
303 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  52.36 
 
 
304 aa  231  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  51.56 
 
 
303 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  51.56 
 
 
303 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.69 
 
 
272 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.06 
 
 
263 aa  230  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  49.4 
 
 
262 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.27 
 
 
254 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  51.63 
 
 
297 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.92 
 
 
252 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.76 
 
 
253 aa  229  3e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.56 
 
 
278 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.19 
 
 
261 aa  229  4e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  49.57 
 
 
261 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  53.22 
 
 
264 aa  229  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  52.7 
 
 
267 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.52 
 
 
307 aa  229  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  45.9 
 
 
254 aa  228  7e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  48.9 
 
 
306 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  51.32 
 
 
264 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
278 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  50.22 
 
 
304 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 
263 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  50.64 
 
 
283 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  51.49 
 
 
285 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  54.67 
 
 
273 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  51.08 
 
 
276 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  54.37 
 
 
258 aa  226  5.0000000000000005e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 
272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  48.67 
 
 
272 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  48.67 
 
 
272 aa  225  6e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  48.85 
 
 
288 aa  225  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.78 
 
 
304 aa  225  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4878  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 
265 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.0921087 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  47.35 
 
 
301 aa  224  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  50.44 
 
 
259 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  54.11 
 
 
256 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  50.89 
 
 
260 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.21 
 
 
274 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.58 
 
 
283 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  53.37 
 
 
290 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.58 
 
 
252 aa  223  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  51.32 
 
 
264 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  51.57 
 
 
272 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50 
 
 
261 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.99 
 
 
284 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49 
 
 
288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0734  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  53.3 
 
 
257 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  49.56 
 
 
259 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  50.71 
 
 
315 aa  222  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  52.25 
 
 
267 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.62 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  47.49 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  50.44 
 
 
259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>