More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1173 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  82.54 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  66.26 
 
 		 263 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  65.34 
 
 		 272 aa  327  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  61.16 
 
 		 297 aa  297  1e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  59.59 
 
 		 262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  58.33 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  57.92 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  57.2 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1233  ABC transporter related  59.29 
 
 		 262 aa  255  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  45.78 
 
 		 279 aa  244  6.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  55.73 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  49.01 
 
 		 273 aa  237  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50.6 
 
 		 272 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  55.36 
 
 		 330 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 		 271 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.56 
 
 		 272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.75 
 
 		 260 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.22 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.2 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 261 aa  221  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  46.75 
 
 		 272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 256 aa  218  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.74 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.59 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  50 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.89 
 
 		 291 aa  215  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  49.1 
 
 		 293 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  49.1 
 
 		 293 aa  215  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.65 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  52.63 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.98 
 
 		 289 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 264 aa  211  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.1 
 
 		 287 aa  210  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  47.2 
 
 		 278 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  47.43 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.44 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.12 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  43.82 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4543  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  43.09 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.37 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  47.79 
 
 		 284 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.34 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  38.8 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.28 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.61 
 
 		 259 aa  207  9e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.15 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.2 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.47 
 
 		 284 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.41 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  48.25 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  48.23 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.68 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.2 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.11 
 
 		 288 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45.42 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.75 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  46.64 
 
 		 268 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  48.67 
 
 		 253 aa  205  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.33 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  46.59 
 
 		 281 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  46.59 
 
 		 281 aa  204  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  46.59 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.78 
 
 		 281 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.68 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.27 
 
 		 273 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.98 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.54 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.02 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.35 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0722  ABC transporter related  48.26 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.56 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  45.15 
 
 		 280 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.67 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  43.75 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.34 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  44.44 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  44.98 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.05 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0845  ABC transporter related  44.88 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5601  ABC transporter related  45.31 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.059714  normal  0.713913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  44.94 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  47.83 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  45.99 
 
 		 255 aa  201  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.04 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  40.8 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  43.15 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2749  sulfonate/taurine ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3059  taurine import ATP-binding protein TauB  41.27 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  46.22 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0106  ABC transporter related  46.61 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.31 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0115  ABC transporter related  46.61 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0919095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0096  ABC transporter related  46.61 
 
 		 259 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3061  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  41.27 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00453099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  46.72 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>