More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9277 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
263 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  73.81 
 
 
272 aa  362  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  66.26 
 
 
253 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  65.85 
 
 
265 aa  331  6e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  59.43 
 
 
241 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  59.02 
 
 
297 aa  292  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  60.74 
 
 
241 aa  292  4e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  58.54 
 
 
262 aa  287  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  58.59 
 
 
265 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1233  ABC transporter related  59.92 
 
 
262 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  52.21 
 
 
273 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10000  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  65.1 
 
 
241 aa  251  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0152878  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  46.15 
 
 
279 aa  251  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  48.29 
 
 
260 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.22 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.48 
 
 
293 aa  232  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.97 
 
 
254 aa  231  6e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.48 
 
 
293 aa  232  6e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.79 
 
 
272 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.6 
 
 
271 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
271 aa  231  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.02 
 
 
263 aa  231  9e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.18 
 
 
254 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.8 
 
 
271 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  49.37 
 
 
265 aa  228  7e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  50 
 
 
313 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  50 
 
 
311 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.37 
 
 
258 aa  227  1e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  49.79 
 
 
311 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50.22 
 
 
284 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  47.88 
 
 
252 aa  226  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.34 
 
 
253 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.16 
 
 
287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  46.99 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
260 aa  225  7e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  47.33 
 
 
267 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.61 
 
 
255 aa  225  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  225  7e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.84 
 
 
272 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.3 
 
 
251 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 
254 aa  221  6e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.09 
 
 
289 aa  221  7e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  52.97 
 
 
292 aa  221  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  50 
 
 
311 aa  221  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.37 
 
 
254 aa  221  9e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
272 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.43 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  49.2 
 
 
264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 
264 aa  219  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  46.31 
 
 
262 aa  219  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
261 aa  219  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.03 
 
 
272 aa  218  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  48.66 
 
 
278 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.56 
 
 
278 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.03 
 
 
297 aa  217  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.15 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.59 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.22 
 
 
253 aa  215  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  49.14 
 
 
280 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.32 
 
 
267 aa  214  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.7 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1284  ABC transporter-like protein  43.67 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0530246 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  46.4 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  49.34 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.09 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  43.32 
 
 
284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.11 
 
 
330 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.46 
 
 
278 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.39 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.73 
 
 
246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  50.22 
 
 
264 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  46.19 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.31 
 
 
256 aa  211  7.999999999999999e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  45.23 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.53 
 
 
275 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  43.67 
 
 
269 aa  211  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.66 
 
 
278 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  41.22 
 
 
439 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
261 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
267 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.58 
 
 
264 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  44.71 
 
 
267 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.27 
 
 
273 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46.22 
 
 
257 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 
253 aa  209  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  45.37 
 
 
252 aa  209  4e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.91 
 
 
261 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
260 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.15 
 
 
262 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
260 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1561  ABC transporter related  45.82 
 
 
291 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000732497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  49.56 
 
 
256 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  44.31 
 
 
274 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
260 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
260 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  52.88 
 
 
260 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.58 
 
 
277 aa  208  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>