More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_24170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 330 aa  640    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  75.99 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  60.58 
 
 		 282 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 261 aa  275  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  51.31 
 
 		 278 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  64.71 
 
 		 289 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  65.07 
 
 		 284 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  65.2 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  50.39 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  47.21 
 
 		 263 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  57.02 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48 
 
 		 262 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  51.28 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  51.08 
 
 		 263 aa  244  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  56.9 
 
 		 274 aa  244  1.9999999999999999e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  50.55 
 
 		 265 aa  239  5e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  49.59 
 
 		 261 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  50 
 
 		 292 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.49 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.75 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  49.55 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  48.78 
 
 		 258 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  59.07 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.35 
 
 		 254 aa  235  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  49.78 
 
 		 254 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  53.12 
 
 		 246 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  54.74 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  49.21 
 
 		 255 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.17 
 
 		 281 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  49.78 
 
 		 254 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  52.89 
 
 		 254 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  55.77 
 
 		 264 aa  229  5e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.28 
 
 		 261 aa  229  6e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.24 
 
 		 280 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  48.25 
 
 		 266 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  52.42 
 
 		 276 aa  228  9e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  53.15 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  51.11 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  53.57 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  54.91 
 
 		 257 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.67 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50.83 
 
 		 278 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  51.36 
 
 		 265 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 261 aa  226  5.0000000000000005e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.62 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.56 
 
 		 288 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  52.21 
 
 		 271 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  52.16 
 
 		 273 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  51.77 
 
 		 271 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  50.88 
 
 		 273 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.1 
 
 		 258 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.15 
 
 		 297 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50.88 
 
 		 254 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  48.82 
 
 		 271 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.81 
 
 		 276 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.96 
 
 		 271 aa  222  8e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.22 
 
 		 263 aa  221  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  53.33 
 
 		 264 aa  221  9e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  52.44 
 
 		 278 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  47.11 
 
 		 256 aa  220  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.95 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  49.12 
 
 		 301 aa  219  7e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  49.31 
 
 		 260 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  46.43 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  51.49 
 
 		 275 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  50.91 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.1 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  49.78 
 
 		 252 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 		 263 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.77 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.09 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  50.22 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  49.34 
 
 		 267 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  50.9 
 
 		 269 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.12 
 
 		 278 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.57 
 
 		 261 aa  215  9e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.09 
 
 		 293 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  45.32 
 
 		 278 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.32 
 
 		 274 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 260 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  52.27 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  49.78 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.55 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  46.77 
 
 		 295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.18 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  48.56 
 
 		 275 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  51.16 
 
 		 275 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.55 
 
 		 278 aa  212  7e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  51.71 
 
 		 260 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  51.54 
 
 		 269 aa  211  9e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  52.94 
 
 		 266 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  48.2 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  55.29 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.86 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.96 
 
 		 284 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 267 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.01 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  52 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  52.65 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>