More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4579 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  66.54 
 
 
284 aa  358  5e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  61.11 
 
 
275 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  51.76 
 
 
259 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  50.57 
 
 
259 aa  270  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  51.57 
 
 
267 aa  258  6e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  51.81 
 
 
281 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  49.21 
 
 
271 aa  248  9e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.41 
 
 
254 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  51.06 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  47.41 
 
 
271 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  47.39 
 
 
260 aa  236  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  50.22 
 
 
257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.4 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  47.04 
 
 
262 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.79 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 
271 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.78 
 
 
258 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  47.37 
 
 
271 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  47.3 
 
 
254 aa  229  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 
254 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  47.11 
 
 
269 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  45.21 
 
 
283 aa  229  5e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.37 
 
 
288 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.51 
 
 
263 aa  225  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.76 
 
 
255 aa  226  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.53 
 
 
258 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.88 
 
 
261 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  46.31 
 
 
263 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  47.58 
 
 
265 aa  223  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.71 
 
 
258 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.88 
 
 
289 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.47 
 
 
254 aa  222  4e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  45.06 
 
 
267 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50 
 
 
289 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  49.55 
 
 
269 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.79 
 
 
276 aa  221  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.71 
 
 
261 aa  221  7e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  50 
 
 
297 aa  221  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  46.4 
 
 
273 aa  221  7e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.34 
 
 
253 aa  221  8e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.73 
 
 
252 aa  221  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  45.71 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  46.09 
 
 
259 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.47 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
264 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  50.22 
 
 
253 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  46.34 
 
 
246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
250 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.47 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45.78 
 
 
333 aa  218  8.999999999999998e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.42 
 
 
272 aa  216  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  46.7 
 
 
263 aa  216  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  48.31 
 
 
284 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.9 
 
 
271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.86 
 
 
281 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.52 
 
 
263 aa  215  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.08 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.98 
 
 
251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  48.21 
 
 
286 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45.16 
 
 
268 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  44.67 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.04 
 
 
261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  43.67 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.74 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  46.4 
 
 
263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  47.58 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.14 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.06 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.66 
 
 
271 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  48.7 
 
 
264 aa  212  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  44.12 
 
 
252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.11 
 
 
272 aa  211  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  44.87 
 
 
272 aa  211  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.25 
 
 
299 aa  211  9e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  45.56 
 
 
445 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  47.44 
 
 
445 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  47.32 
 
 
280 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  48.4 
 
 
280 aa  210  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  45.06 
 
 
267 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  44.05 
 
 
265 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46 
 
 
264 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  41.27 
 
 
274 aa  209  3e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  42.74 
 
 
269 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.86 
 
 
261 aa  209  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.65 
 
 
262 aa  209  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  49.04 
 
 
290 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.33 
 
 
267 aa  208  6e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
256 aa  208  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  43.75 
 
 
263 aa  207  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.37 
 
 
259 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.68 
 
 
244 aa  207  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.67 
 
 
263 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.28 
 
 
304 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.46 
 
 
293 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>