More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1308 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  100 
 
 
252 aa  525  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  56.05 
 
 
266 aa  301  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  53.78 
 
 
267 aa  289  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  54 
 
 
267 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  54.92 
 
 
266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  53.57 
 
 
274 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  52.89 
 
 
269 aa  278  6e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  53.01 
 
 
274 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  54.77 
 
 
267 aa  275  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.16 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  51.01 
 
 
252 aa  271  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 
284 aa  270  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  50.78 
 
 
284 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  51.65 
 
 
246 aa  268  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  52.36 
 
 
282 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  50.59 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  50.61 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  50.2 
 
 
276 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  49.41 
 
 
299 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.3 
 
 
276 aa  265  5.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  49.41 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  49.41 
 
 
304 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  51.6 
 
 
276 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  51.22 
 
 
267 aa  263  2e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.8 
 
 
277 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  51.42 
 
 
270 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50 
 
 
271 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  51.44 
 
 
257 aa  247  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  44.67 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  46.85 
 
 
259 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  48.7 
 
 
246 aa  229  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.42 
 
 
274 aa  229  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.08 
 
 
265 aa  224  8e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  51.06 
 
 
258 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  43.43 
 
 
259 aa  223  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  42.63 
 
 
273 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.83 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  45.26 
 
 
276 aa  219  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 
254 aa  216  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  44.58 
 
 
299 aa  216  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.28 
 
 
261 aa  216  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.67 
 
 
268 aa  215  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  44.36 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.97 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  43.15 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.23 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.33 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  46.64 
 
 
264 aa  211  5.999999999999999e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.4 
 
 
244 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.05 
 
 
274 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  209  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  46.51 
 
 
276 aa  209  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
268 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  43.91 
 
 
254 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  45.37 
 
 
263 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  208  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  42.04 
 
 
244 aa  208  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.77 
 
 
271 aa  208  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  40.55 
 
 
264 aa  208  8e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.82 
 
 
254 aa  208  8e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  45.11 
 
 
257 aa  207  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  44.64 
 
 
276 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  44.78 
 
 
261 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  49.77 
 
 
258 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.02 
 
 
278 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.52 
 
 
297 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  49.28 
 
 
284 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.28 
 
 
289 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  47.66 
 
 
273 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  44.49 
 
 
233 aa  206  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.8 
 
 
284 aa  204  8e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.15 
 
 
261 aa  204  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.54 
 
 
252 aa  204  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.65 
 
 
251 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.02 
 
 
254 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.16 
 
 
267 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  42.42 
 
 
244 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
264 aa  202  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
258 aa  202  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.29 
 
 
330 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  40.66 
 
 
244 aa  202  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.64 
 
 
266 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.92 
 
 
263 aa  201  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.03 
 
 
254 aa  202  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.27 
 
 
245 aa  201  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  45.89 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03350  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  39.68 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47 
 
 
260 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.98 
 
 
253 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.21 
 
 
261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  42.57 
 
 
257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.2 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.92 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.22 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 
251 aa  199  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.61 
 
 
267 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.02 
 
 
263 aa  199  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  46.05 
 
 
261 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>