More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0889 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  100 
 
 
439 aa  875    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  78.2 
 
 
436 aa  665    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  76.5 
 
 
436 aa  665    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  63.12 
 
 
434 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.63 
 
 
432 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.82 
 
 
458 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  49.88 
 
 
454 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 
435 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  48.33 
 
 
435 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  48.28 
 
 
437 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  46.35 
 
 
426 aa  372  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  50.12 
 
 
437 aa  370  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  51.23 
 
 
445 aa  371  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  48.59 
 
 
437 aa  369  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  47.32 
 
 
435 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  50.37 
 
 
445 aa  365  1e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  44.76 
 
 
432 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  44.76 
 
 
432 aa  363  4e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
440 aa  362  9e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  44.19 
 
 
438 aa  361  1e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 
434 aa  362  1e-98  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  45.52 
 
 
447 aa  360  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.1 
 
 
448 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  45.64 
 
 
448 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  46.79 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  46.79 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  46.79 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  46.79 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  47.85 
 
 
446 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  47.61 
 
 
448 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  46.79 
 
 
445 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  44.95 
 
 
444 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.92 
 
 
446 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  45.56 
 
 
448 aa  352  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  47.61 
 
 
445 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.37 
 
 
445 aa  350  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  45.64 
 
 
448 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  47.37 
 
 
453 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  47.61 
 
 
450 aa  351  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  47.51 
 
 
448 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  47.51 
 
 
448 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  47.51 
 
 
448 aa  349  6e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.27 
 
 
448 aa  348  8e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  43.86 
 
 
433 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
434 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  43.91 
 
 
441 aa  345  6e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  44.57 
 
 
433 aa  345  7e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  45.27 
 
 
433 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  45.03 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 
511 aa  332  6e-90  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  43.49 
 
 
453 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  43.65 
 
 
439 aa  325  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  43.91 
 
 
457 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  43.91 
 
 
457 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  43.4 
 
 
448 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  43.91 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  43.91 
 
 
436 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  43.09 
 
 
448 aa  309  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  44.73 
 
 
454 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
438 aa  306  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 
438 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  44.26 
 
 
457 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  43.41 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  39.01 
 
 
434 aa  299  7e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  42.69 
 
 
439 aa  293  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  55.69 
 
 
249 aa  284  3.0000000000000004e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  41.94 
 
 
447 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  42.32 
 
 
447 aa  277  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.15 
 
 
244 aa  252  1e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.56 
 
 
244 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.56 
 
 
244 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.5 
 
 
244 aa  236  7e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  48.19 
 
 
245 aa  230  4e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.84 
 
 
260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  48.43 
 
 
260 aa  226  5.0000000000000005e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.99 
 
 
264 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 
281 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  49.56 
 
 
274 aa  219  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.67 
 
 
253 aa  218  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.71 
 
 
258 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  47.7 
 
 
264 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.31 
 
 
297 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.83 
 
 
259 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.86 
 
 
263 aa  216  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  42.58 
 
 
263 aa  216  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.15 
 
 
267 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  47.5 
 
 
279 aa  216  9e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
261 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.06 
 
 
261 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  41.94 
 
 
256 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  46.74 
 
 
264 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  40.08 
 
 
256 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  47.08 
 
 
279 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>