More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1270 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  100 
 
 		 447 aa  894    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  68.93 
 
 		 448 aa  616  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  68.75 
 
 		 433 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  68.53 
 
 		 446 aa  604  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  67.13 
 
 		 433 aa  591  1e-168  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  66.59 
 
 		 441 aa  590  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  67.91 
 
 		 433 aa  589  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  66.74 
 
 		 433 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  64.77 
 
 		 444 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  66.06 
 
 		 434 aa  569  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  66.82 
 
 		 439 aa  565  1e-160  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  62.7 
 
 		 446 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  65.13 
 
 		 446 aa  556  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  66.28 
 
 		 435 aa  552  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  64.41 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.1 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  64.41 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  64.41 
 
 		 453 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  64.41 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  61.78 
 
 		 445 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  61.56 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  64.41 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  64.41 
 
 		 448 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  64.16 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  64.16 
 
 		 450 aa  548  1e-155  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  61.33 
 
 		 448 aa  549  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  64.16 
 
 		 445 aa  551  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  63.92 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  61.24 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  63.92 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  63.92 
 
 		 448 aa  546  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  63.17 
 
 		 437 aa  543  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  61.09 
 
 		 453 aa  531  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  60.56 
 
 		 435 aa  514  1e-144  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  60.42 
 
 		 435 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  57.28 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  57.28 
 
 		 436 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  56.41 
 
 		 445 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  53.72 
 
 		 434 aa  472  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  54.78 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  54.78 
 
 		 432 aa  471  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  53.72 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  55.82 
 
 		 437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  57.04 
 
 		 454 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  56.6 
 
 		 445 aa  463  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  55.98 
 
 		 437 aa  449  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  55.61 
 
 		 457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  55.61 
 
 		 438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  54.89 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  53.24 
 
 		 447 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  51.71 
 
 		 432 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  50.23 
 
 		 448 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  46.56 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  49.07 
 
 		 426 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  49.54 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  48.96 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1459  ABC transporter ATP-binding protein  68.94 
 
 		 262 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  48.82 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  48.82 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  50.48 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  49.05 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  45.52 
 
 		 439 aa  360  2e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  46.8 
 
 		 436 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.5 
 
 		 436 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 		 511 aa  343  4e-93  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  43.98 
 
 		 434 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  54.51 
 
 		 249 aa  275  1.0000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  37.87 
 
 		 434 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  71.88 
 
 		 211 aa  247  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  48.98 
 
 		 244 aa  244  3e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  72.84 
 
 		 175 aa  239  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  47.13 
 
 		 244 aa  238  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.53 
 
 		 244 aa  236  8e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  45.71 
 
 		 244 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  47.19 
 
 		 256 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 		 281 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.8 
 
 		 263 aa  223  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.39 
 
 		 274 aa  223  8e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  45.89 
 
 		 257 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  49.79 
 
 		 245 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  47.95 
 
 		 275 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.91 
 
 		 251 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.58 
 
 		 258 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  46.21 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  46.21 
 
 		 265 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 254 aa  216  7e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.25 
 
 		 255 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 278 aa  213  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  42.48 
 
 		 261 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  43.43 
 
 		 286 aa  213  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44.64 
 
 		 297 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  47 
 
 		 257 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>