More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7463 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7463  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 211 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  79.49 
 
 		 433 aa  310  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5550  ABC transporter, ATP-binding protein  78.46 
 
 		 434 aa  305  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  77.32 
 
 		 435 aa  293  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  71.88 
 
 		 447 aa  266  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  71.5 
 
 		 433 aa  266  1e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  71.5 
 
 		 433 aa  266  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  69.07 
 
 		 446 aa  264  7e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.87 
 
 		 448 aa  262  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  261  4e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  68.39 
 
 		 433 aa  258  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  72.34 
 
 		 448 aa  257  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  72.34 
 
 		 445 aa  256  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  256  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  72.34 
 
 		 450 aa  257  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  71.43 
 
 		 448 aa  256  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  72.34 
 
 		 445 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  72.34 
 
 		 445 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  72.34 
 
 		 453 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  72.34 
 
 		 445 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  72.34 
 
 		 445 aa  256  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  72.34 
 
 		 448 aa  256  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  71.81 
 
 		 445 aa  254  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  71.81 
 
 		 445 aa  254  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  71.28 
 
 		 446 aa  254  8e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  71.81 
 
 		 446 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  64.74 
 
 		 445 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  67.72 
 
 		 441 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  63.08 
 
 		 445 aa  243  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  66.49 
 
 		 435 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  68.23 
 
 		 444 aa  241  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  65.31 
 
 		 435 aa  241  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  64.92 
 
 		 453 aa  241  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  65.96 
 
 		 437 aa  239  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  67.02 
 
 		 439 aa  236  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 		 454 aa  232  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0768  ABC transporter, ATP-binding protein  62.83 
 
 		 438 aa  231  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0934  putative ATP-binding transmembrane ABC transporter  62.83 
 
 		 457 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0758  ABC transporter, ATP-binding protein  62.83 
 
 		 438 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  57.36 
 
 		 434 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  57.36 
 
 		 438 aa  229  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  59.26 
 
 		 432 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  59.26 
 
 		 432 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  64.33 
 
 		 432 aa  228  5e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  61.7 
 
 		 440 aa  226  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  60.64 
 
 		 436 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  60.64 
 
 		 436 aa  225  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  57.89 
 
 		 437 aa  223  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  59.79 
 
 		 448 aa  222  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  57.67 
 
 		 454 aa  221  8e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  60.2 
 
 		 437 aa  220  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  57.07 
 
 		 511 aa  216  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  60.11 
 
 		 447 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  57.07 
 
 		 457 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1456  ABC transporter ATP-binding protein  67.7 
 
 		 175 aa  209  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.647308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  57.07 
 
 		 457 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6182  ABC transporter related  62.78 
 
 		 447 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.702393  normal  0.527312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  56.38 
 
 		 426 aa  206  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  59.79 
 
 		 448 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  56.68 
 
 		 458 aa  206  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  59.16 
 
 		 439 aa  205  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  54.17 
 
 		 439 aa  201  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  59.57 
 
 		 449 aa  201  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  53.19 
 
 		 436 aa  198  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  53.72 
 
 		 434 aa  198  6e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  49.49 
 
 		 436 aa  194  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3820  ABC transporter, ATPase subunit  50.53 
 
 		 434 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  50.53 
 
 		 249 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  49.18 
 
 		 244 aa  174  6e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  171  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.28 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  51.1 
 
 		 264 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  47.15 
 
 		 297 aa  168  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  47.18 
 
 		 254 aa  167  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  47.69 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  48.4 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.26 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3254  ABC transporter related  45.11 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0994591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  49.09 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.09 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  41.94 
 
 		 252 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  46.45 
 
 		 261 aa  161  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.97 
 
 		 244 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.32 
 
 		 272 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.88 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  50.31 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  48.55 
 
 		 258 aa  158  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  47.4 
 
 		 292 aa  158  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.8 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>