More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0679 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  81.15 
 
 		 244 aa  422  1e-117  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  79.92 
 
 		 244 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  77.87 
 
 		 244 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  55.28 
 
 		 245 aa  266  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  51.02 
 
 		 426 aa  248  8e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  47.54 
 
 		 434 aa  244  8e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  47.54 
 
 		 438 aa  244  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.13 
 
 		 446 aa  241  6e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  48.37 
 
 		 249 aa  241  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  48.36 
 
 		 433 aa  240  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  49.12 
 
 		 432 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  48.77 
 
 		 435 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  47.13 
 
 		 447 aa  238  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  46.5 
 
 		 439 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  46.96 
 
 		 453 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  48.36 
 
 		 448 aa  231  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  45.9 
 
 		 437 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 446 aa  231  9e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.01 
 
 		 445 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  47.01 
 
 		 450 aa  229  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  47.01 
 
 		 448 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  47.01 
 
 		 445 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  47.01 
 
 		 445 aa  229  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  47.01 
 
 		 445 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  47.01 
 
 		 453 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  47.01 
 
 		 445 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  47.01 
 
 		 445 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 		 511 aa  229  3e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  47.11 
 
 		 444 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  48.66 
 
 		 441 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  44.49 
 
 		 432 aa  228  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  44.49 
 
 		 432 aa  228  5e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  47.01 
 
 		 448 aa  228  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  47.96 
 
 		 258 aa  228  5e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.58 
 
 		 448 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  46.58 
 
 		 445 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  50.88 
 
 		 440 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  46.58 
 
 		 448 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  46.58 
 
 		 448 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  46.58 
 
 		 448 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  46.58 
 
 		 448 aa  227  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  45.27 
 
 		 436 aa  226  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.15 
 
 		 448 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  48.66 
 
 		 457 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  46.31 
 
 		 439 aa  224  7e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  44.86 
 
 		 436 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  48.66 
 
 		 457 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  47.33 
 
 		 435 aa  223  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  46.5 
 
 		 434 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 256 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  49.12 
 
 		 445 aa  223  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  48.44 
 
 		 437 aa  222  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  48.67 
 
 		 445 aa  222  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.41 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  45.34 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  47.13 
 
 		 458 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  48.73 
 
 		 256 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.46 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  45.34 
 
 		 436 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  49.15 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.42 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  44.16 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  49.11 
 
 		 454 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  44.49 
 
 		 448 aa  215  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  50.66 
 
 		 265 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  45.9 
 
 		 449 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.15 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.28 
 
 		 254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 		 252 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3186  ABC transporter-related protein  44.9 
 
 		 448 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.19185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.82 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.64 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  50.92 
 
 		 263 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.37 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5922  ABC transporter related  46.43 
 
 		 447 aa  210  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.390336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  48.31 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  48.29 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  43.78 
 
 		 433 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  45.73 
 
 		 258 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0621  ABC transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 454 aa  209  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1756  ABC transporter related  45.31 
 
 		 433 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1824  putative nitrate transport system ATP-binding protein  45.31 
 
 		 433 aa  209  3e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  48.29 
 
 		 265 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3496  hypothetical protein  49.33 
 
 		 437 aa  209  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  42.74 
 
 		 262 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>