More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0800 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  100 
 
 
276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  58.17 
 
 
267 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  59.29 
 
 
266 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.75 
 
 
266 aa  298  5e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  56.49 
 
 
274 aa  296  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  56.3 
 
 
274 aa  294  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  60.08 
 
 
276 aa  292  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  60.57 
 
 
267 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  58.08 
 
 
270 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  59.76 
 
 
267 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  57.09 
 
 
252 aa  282  5.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.49 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  60.67 
 
 
271 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  54.28 
 
 
269 aa  278  8e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  57.55 
 
 
267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  51.79 
 
 
284 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  53.14 
 
 
268 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  56.05 
 
 
246 aa  267  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  50.2 
 
 
252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54.09 
 
 
284 aa  260  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.66 
 
 
277 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 
282 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  54.22 
 
 
246 aa  255  6e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  55.38 
 
 
257 aa  255  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  51.94 
 
 
304 aa  254  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  51.55 
 
 
306 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  50.77 
 
 
299 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  51.19 
 
 
261 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  52.99 
 
 
276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  52.02 
 
 
259 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  52.61 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49.8 
 
 
274 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.94 
 
 
276 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.24 
 
 
254 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.75 
 
 
274 aa  214  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  45.49 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.44 
 
 
254 aa  211  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  44.79 
 
 
256 aa  211  9e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.51 
 
 
261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.25 
 
 
278 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  46.36 
 
 
257 aa  209  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 
259 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.6 
 
 
278 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  44.27 
 
 
299 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.71 
 
 
260 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.34 
 
 
253 aa  208  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.65 
 
 
254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.82 
 
 
281 aa  207  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  44.17 
 
 
244 aa  206  4e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  48.41 
 
 
258 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  44.78 
 
 
440 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.17 
 
 
258 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.75 
 
 
265 aa  206  5e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  49.78 
 
 
246 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  47.26 
 
 
333 aa  205  7e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  46.03 
 
 
263 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  50.43 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  44.7 
 
 
288 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  50 
 
 
281 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.27 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  45 
 
 
260 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  47.92 
 
 
265 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  41.51 
 
 
269 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
261 aa  204  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  50.22 
 
 
259 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  47.92 
 
 
265 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  44.35 
 
 
247 aa  203  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.7 
 
 
258 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  47.79 
 
 
311 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.14 
 
 
253 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.31 
 
 
278 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  47.79 
 
 
311 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.35 
 
 
267 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  47.39 
 
 
259 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  45.78 
 
 
259 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  47.92 
 
 
278 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.7 
 
 
259 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.31 
 
 
259 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.41 
 
 
261 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.64 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  46.9 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.58 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.96 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  44.02 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.96 
 
 
233 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  49.33 
 
 
259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  50.21 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  48.89 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.56 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 
261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  44.09 
 
 
259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  43.33 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  46.72 
 
 
264 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  46.7 
 
 
251 aa  199  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  44.58 
 
 
260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.21 
 
 
262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  42.57 
 
 
432 aa  199  5e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  46.96 
 
 
263 aa  199  5e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>