More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0408 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  93.05 
 
 		 259 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  92.28 
 
 		 259 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  75.59 
 
 		 260 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  77.05 
 
 		 260 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  64.46 
 
 		 261 aa  312  2.9999999999999996e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  61.73 
 
 		 252 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  60.49 
 
 		 245 aa  304  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  62.81 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  59.02 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  63.79 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.89 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  51.1 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  49.79 
 
 		 286 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.12 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  46.64 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.21 
 
 		 254 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  48.34 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.56 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  51.82 
 
 		 245 aa  211  7.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.78 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.97 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  48.54 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.62 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4034  ABC transporter related  51.13 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.105857 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.49 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.39 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  41.42 
 
 		 265 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  49.57 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  47.54 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  42.8 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.12 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.21 
 
 		 262 aa  207  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  45.26 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.53 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.62 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  45.33 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 271 aa  204  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  45.19 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.69 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.19 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.25 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  42.58 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.31 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  48.23 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  49.54 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.36 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  46.5 
 
 		 256 aa  202  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7505  ABC transporter, ATPase subunit  50.23 
 
 		 273 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000247297  normal  0.575396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  50.43 
 
 		 271 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.58 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.04 
 
 		 252 aa  201  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.08 
 
 		 246 aa  201  9e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  45.93 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  47.62 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.12 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.1 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.25 
 
 		 265 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.3 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  42.74 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  47.62 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.25 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  47.17 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  45.82 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  47.51 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  47.32 
 
 		 245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48.43 
 
 		 255 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  48.33 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.45 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  48.54 
 
 		 263 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  43.87 
 
 		 260 aa  199  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6344  ABC transporter related  49.14 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.942875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.61 
 
 		 269 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  42.8 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.03 
 
 		 283 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  44.96 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  46.09 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  44.35 
 
 		 304 aa  198  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  44.77 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6521  ABC transporter related  49.32 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 247 aa  198  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6755  ABC transporter related  49.32 
 
 		 270 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0664482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  53.14 
 
 		 288 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  43.87 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  51.11 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.91 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  42.73 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  43.08 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.78 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  47.2 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  44.21 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>