More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0892 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  100 
 
 		 252 aa  506  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  59.36 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  58.82 
 
 		 266 aa  299  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.31 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.89 
 
 		 274 aa  285  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  57.03 
 
 		 274 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.09 
 
 		 276 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  60.49 
 
 		 267 aa  278  5e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  56.91 
 
 		 284 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  58.61 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  57.48 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  54.07 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  51.01 
 
 		 252 aa  271  6e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  54.09 
 
 		 261 aa  268  7e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  55.69 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54.37 
 
 		 284 aa  267  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  54.76 
 
 		 299 aa  266  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.44 
 
 		 324 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  54.37 
 
 		 304 aa  263  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  54.76 
 
 		 306 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  57.08 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  54.39 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  54.92 
 
 		 277 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  56.97 
 
 		 259 aa  259  4e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  56.28 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  55.14 
 
 		 271 aa  254  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  54.12 
 
 		 276 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  55.92 
 
 		 257 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  54.1 
 
 		 246 aa  243  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.32 
 
 		 281 aa  218  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.24 
 
 		 299 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  47.73 
 
 		 275 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  47.77 
 
 		 278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  49.21 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.9 
 
 		 244 aa  211  9e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 254 aa  210  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  47.23 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.81 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  47.76 
 
 		 284 aa  210  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.32 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.28 
 
 		 244 aa  208  7e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.81 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.22 
 
 		 278 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  51.87 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  48.9 
 
 		 262 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.28 
 
 		 244 aa  206  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.74 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.61 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 268 aa  205  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.98 
 
 		 283 aa  205  6e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.86 
 
 		 258 aa  204  8e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  49.78 
 
 		 271 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  47.58 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  44.98 
 
 		 434 aa  203  2e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.56 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.35 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  47.58 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.07 
 
 		 253 aa  203  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.25 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.68 
 
 		 254 aa  201  6e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.21 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  45.56 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.37 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  45.93 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  48.99 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.74 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  45.49 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.91 
 
 		 261 aa  199  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.04 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  43.7 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  47.19 
 
 		 259 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 		 259 aa  198  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.25 
 
 		 276 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  45.12 
 
 		 259 aa  197  9e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.11 
 
 		 435 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  47.28 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.23 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  48.46 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.35 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  44.54 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.65 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  46.48 
 
 		 282 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  48.02 
 
 		 270 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  48.03 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.7 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.31 
 
 		 278 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.35 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.06 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  44.72 
 
 		 259 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  50.48 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 		 252 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  45.15 
 
 		 278 aa  195  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3265  ABC transporter related  47.14 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.952951 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>