More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2628 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  100 
 
 		 275 aa  555  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  57.45 
 
 		 267 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  55.16 
 
 		 311 aa  289  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  58.11 
 
 		 283 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  45.65 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.4 
 
 		 278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  45.38 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.53 
 
 		 281 aa  215  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  43.3 
 
 		 263 aa  215  5.9999999999999996e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.61 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  47.73 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  44.03 
 
 		 262 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  46.27 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  46.27 
 
 		 284 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.07 
 
 		 254 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.26 
 
 		 254 aa  211  9e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.02 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.75 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  41.95 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.45 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.7 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  41.79 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  46.85 
 
 		 246 aa  209  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.7 
 
 		 254 aa  208  7e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.53 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  41.95 
 
 		 261 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 291 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  42.91 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.12 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.31 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  41.95 
 
 		 278 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.32 
 
 		 274 aa  206  5e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.95 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.59 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  45.39 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  42.86 
 
 		 333 aa  203  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  42.7 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  43.49 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.59 
 
 		 255 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.25 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  43.07 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  43.07 
 
 		 265 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.23 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  44.53 
 
 		 264 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.28 
 
 		 268 aa  198  7e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  45.67 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.74 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.57 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  40.55 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  45.85 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  43.17 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  41.35 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  46.79 
 
 		 275 aa  194  9e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2560  ABC transporter related  41.13 
 
 		 271 aa  194  9e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  46.25 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  42.02 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  42.69 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  41.35 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2359  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.86 
 
 		 259 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.504714 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  43.31 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  40.23 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  43.18 
 
 		 268 aa  192  4e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4255  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0122186  normal  0.606643 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  40.23 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.51 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  40.39 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  40.15 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  44.19 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  42.59 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  42.48 
 
 		 272 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3203  ABC transporter related  37.73 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565389  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  39.16 
 
 		 251 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  43.89 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  48.88 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  41 
 
 		 260 aa  189  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.7 
 
 		 284 aa  189  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.38 
 
 		 257 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  44.22 
 
 		 276 aa  189  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  41.67 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  41.67 
 
 		 252 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  36.86 
 
 		 250 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  41.67 
 
 		 252 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  42.37 
 
 		 287 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.5 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  39.67 
 
 		 272 aa  188  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 		 297 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  40.82 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  41.98 
 
 		 286 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  43.48 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 		 263 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  41.26 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  38.72 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  40.98 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3410  ABC transporter related  42.38 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0325873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>