More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3034 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  532  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  64.71 
 
 		 278 aa  334  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  55.41 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  51.26 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.3 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 273 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.18 
 
 		 273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.33 
 
 		 281 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  48.41 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  49.37 
 
 		 255 aa  240  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  51.9 
 
 		 254 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  46.74 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 261 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.41 
 
 		 261 aa  234  8e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.97 
 
 		 268 aa  234  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.18 
 
 		 278 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  45.31 
 
 		 261 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.71 
 
 		 258 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  51.32 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.39 
 
 		 262 aa  229  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.38 
 
 		 278 aa  228  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49.16 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.9 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.61 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50.66 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.89 
 
 		 330 aa  225  5.0000000000000005e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  42.08 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  45.83 
 
 		 259 aa  224  1e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.58 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.59 
 
 		 267 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.42 
 
 		 259 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  45.16 
 
 		 269 aa  221  7e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  44.08 
 
 		 263 aa  221  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.78 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.08 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.12 
 
 		 289 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.43 
 
 		 251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  50.4 
 
 		 434 aa  219  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  45.75 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  50.4 
 
 		 438 aa  219  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  45.75 
 
 		 271 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46 
 
 		 257 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50.45 
 
 		 284 aa  218  6e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.17 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  49.79 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  47.11 
 
 		 244 aa  218  7.999999999999999e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.75 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  43.95 
 
 		 284 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  47.14 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.45 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.92 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  44.08 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  49.78 
 
 		 281 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  50.44 
 
 		 260 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  48.46 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  47.66 
 
 		 259 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  50.88 
 
 		 288 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  45.64 
 
 		 268 aa  215  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.12 
 
 		 259 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.09 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  49.13 
 
 		 285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  47.11 
 
 		 281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.28 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4887  ABC transporter related  50.88 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.546298  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  48.16 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  49.56 
 
 		 265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  43.53 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.22 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  48.25 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  50.22 
 
 		 298 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.1 
 
 		 281 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.96 
 
 		 244 aa  211  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  46.09 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.4 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  43.25 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.89 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  45.64 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  49.34 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  43.25 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.61 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  49.34 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  49.34 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.78 
 
 		 283 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  51.57 
 
 		 275 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 426 aa  209  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.78 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 256 aa  209  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.98 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 		 282 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.65 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  43.87 
 
 		 432 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  43.87 
 
 		 432 aa  209  4e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.86 
 
 		 283 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  45.22 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>