More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3167 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  73.49 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  51.37 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  52.12 
 
 		 271 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  50.19 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  52.26 
 
 		 271 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  51.84 
 
 		 267 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50 
 
 		 278 aa  242  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  50.62 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.98 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  50.42 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.95 
 
 		 275 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.37 
 
 		 262 aa  234  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  48.99 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  52.56 
 
 		 258 aa  228  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  53.02 
 
 		 257 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.09 
 
 		 284 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  46.62 
 
 		 283 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  48.51 
 
 		 286 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  49.79 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  48.58 
 
 		 262 aa  221  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.75 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  44.49 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.02 
 
 		 263 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  44.66 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.22 
 
 		 257 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 		 281 aa  218  8.999999999999998e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.64 
 
 		 254 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 289 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.49 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.39 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  48.31 
 
 		 284 aa  212  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.01 
 
 		 273 aa  211  9e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  48.94 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.81 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 263 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 311 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  49.78 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.81 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  44.57 
 
 		 265 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  48.51 
 
 		 246 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  43.22 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.22 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.81 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.43 
 
 		 288 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.16 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.69 
 
 		 308 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  45.02 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.76 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.25 
 
 		 244 aa  206  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.78 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0832  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.75 
 
 		 266 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0180389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  43.82 
 
 		 259 aa  205  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 291 aa  204  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  45.73 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.1 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.88 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  43.12 
 
 		 287 aa  202  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  47.5 
 
 		 276 aa  202  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.75 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  45.8 
 
 		 453 aa  201  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4457  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.87 
 
 		 668 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.28 
 
 		 273 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4394  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.87 
 
 		 668 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  42.57 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0325  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.81 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.73 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.83 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.15 
 
 		 307 aa  199  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  43.46 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  40.96 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3269  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  42.35 
 
 		 270 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.454908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  42.19 
 
 		 311 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  44.03 
 
 		 448 aa  198  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  42.39 
 
 		 246 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.95 
 
 		 291 aa  198  6e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  43.32 
 
 		 282 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0235  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  45.58 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.926583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.11 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.02 
 
 		 267 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 261 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2103  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.12 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0097031  normal  0.0581699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.22 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.3 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  47.2 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  44.3 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.3 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.69 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  45.92 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.75 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.8 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>