More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0190 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  86.89 
 
 
244 aa  443  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  81.15 
 
 
244 aa  422  1e-117  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  79.92 
 
 
244 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  54.44 
 
 
245 aa  264  8.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0406  ABC transporter related  50.4 
 
 
249 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0871971  decreased coverage  0.00677494 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  48.98 
 
 
434 aa  249  3e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 
438 aa  249  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  47.18 
 
 
432 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
426 aa  246  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  47.56 
 
 
439 aa  242  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.56 
 
 
446 aa  235  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7489  ABC transporter ATP-binding protein  47.97 
 
 
433 aa  235  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.57359  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0164  ABC transporter related  46.34 
 
 
436 aa  234  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0972  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.66 
 
 
448 aa  234  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4594  ABC transporter related  45.93 
 
 
436 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.138769  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5527  ABC transporter related  46.84 
 
 
448 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.690154 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3611  ABC transporter related  46.84 
 
 
448 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4756  ABC transporter related  46.84 
 
 
448 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.230075 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  45.71 
 
 
447 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  44.94 
 
 
435 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5724  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.23 
 
 
445 aa  232  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4139  ABC transporter related  47.23 
 
 
453 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4604  ABC transporter related  47.23 
 
 
448 aa  231  6e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.988663  normal  0.150792 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2401  ABC transporter related  47.23 
 
 
445 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.381271  normal  0.0482566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2306  ABC transporter related  47.23 
 
 
445 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.72885  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3900  ABC transporter related  47.23 
 
 
450 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.424628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2442  ABC transporter related  47.23 
 
 
445 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.383367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0893  ABC transporter related  47.23 
 
 
445 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815401 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2397  ABC transporter related  47.23 
 
 
445 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.579445  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0896  ABC transporter related  45.89 
 
 
257 aa  230  1e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.152369  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4341  ABC transporter related  46.94 
 
 
448 aa  230  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0897  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  230  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0347  ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 
511 aa  230  2e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0755  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0136  hypothetical protein  45.16 
 
 
432 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0121  hypothetical protein  45.16 
 
 
432 aa  229  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1259  putative ABC transport system, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1099  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2155  ABC transporter related  46.81 
 
 
448 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186456 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1785  ABC transporter related  46.81 
 
 
445 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1104  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458169  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1569  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.36109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0998  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3028  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 
446 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.745628  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1130  ABC transporter related  46.41 
 
 
448 aa  229  4e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3382  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.99 
 
 
448 aa  228  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.433884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1617  ABC transporter related  45.56 
 
 
444 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.108127  normal  0.267106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1439  ABC transporter related  45.75 
 
 
439 aa  228  6e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.94 
 
 
258 aa  228  6e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  49.59 
 
 
440 aa  228  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
256 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.83 
 
 
254 aa  227  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0523  ABC transporter-related protein  44.13 
 
 
435 aa  227  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0693  ABC transporter, conserved site  45.97 
 
 
441 aa  227  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3247  ABC transporter related  45.56 
 
 
457 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0430  ABC transporter related protein  43.72 
 
 
437 aa  225  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0802  ABC transporter related  46.75 
 
 
434 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3545  ABC transporter related  45.96 
 
 
453 aa  224  6e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  46.09 
 
 
262 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3570  ABC transporter related  45.16 
 
 
457 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.886427 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  46.15 
 
 
436 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  46.15 
 
 
436 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  47.13 
 
 
251 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  51.09 
 
 
263 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  51.08 
 
 
265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  51.08 
 
 
265 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 
262 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  42.21 
 
 
256 aa  217  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  45.49 
 
 
263 aa  217  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  48.02 
 
 
445 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3372  ABC transporter ATP-binding protein  45.56 
 
 
449 aa  216  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0110  ABC transporter related  47.81 
 
 
445 aa  217  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1020  ABC transporter-like protein  44.9 
 
 
437 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.381169 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  45.16 
 
 
458 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0271  ABC transporter related  45.12 
 
 
435 aa  215  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.342926 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2719  ABC transporter related protein  46.77 
 
 
454 aa  215  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 
254 aa  215  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42.39 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.44 
 
 
254 aa  214  7e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.85 
 
 
254 aa  214  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  46.09 
 
 
254 aa  214  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.18 
 
 
263 aa  214  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  44.49 
 
 
267 aa  214  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  49.34 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.49 
 
 
252 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  46.41 
 
 
261 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  45.93 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  45.99 
 
 
252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.15 
 
 
258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3031  ABC transporter related  43.15 
 
 
448 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.146776  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.93 
 
 
280 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  49.3 
 
 
253 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5090  ABC transporter  43.2 
 
 
433 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.13 
 
 
281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.34 
 
 
258 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  45.49 
 
 
263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.96 
 
 
265 aa  211  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0111  ABC transporter-related protein  44.35 
 
 
439 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>