More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1860 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  93.44 
 
 		 259 aa  497  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  55.78 
 
 		 271 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  54.62 
 
 		 281 aa  296  3e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  56.63 
 
 		 271 aa  295  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  55.51 
 
 		 254 aa  295  6e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  56.18 
 
 		 284 aa  293  3e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.51 
 
 		 276 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  54.58 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  51.76 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  49.59 
 
 		 275 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  50.8 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 275 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.86 
 
 		 257 aa  261  8.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.98 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  50.19 
 
 		 262 aa  257  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  52.48 
 
 		 278 aa  252  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  52.92 
 
 		 283 aa  251  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.76 
 
 		 278 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 289 aa  244  9e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  48.03 
 
 		 263 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  50.44 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.19 
 
 		 289 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 264 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  52.94 
 
 		 281 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  48.15 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.15 
 
 		 259 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  48.76 
 
 		 284 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.54 
 
 		 278 aa  237  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  48.5 
 
 		 272 aa  235  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  46.43 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  48.16 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  48.98 
 
 		 266 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  44.8 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.74 
 
 		 269 aa  235  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  46.94 
 
 		 265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  44.58 
 
 		 263 aa  235  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  48.99 
 
 		 333 aa  235  6e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  44.98 
 
 		 272 aa  235  6e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.95 
 
 		 288 aa  235  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  44.8 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.45 
 
 		 258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  47.6 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.35 
 
 		 284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  46.78 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  46.8 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  44.98 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  48.93 
 
 		 280 aa  232  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  48.74 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 259 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.32 
 
 		 307 aa  231  8.000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.03 
 
 		 254 aa  231  8.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  46.84 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  47.35 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.67 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  46.22 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.62 
 
 		 254 aa  230  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.94 
 
 		 255 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  42.64 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.91 
 
 		 283 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 278 aa  229  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  46.7 
 
 		 254 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 258 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  46.06 
 
 		 259 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  51.33 
 
 		 276 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  47.7 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.34 
 
 		 260 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  45.8 
 
 		 275 aa  227  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.98 
 
 		 274 aa  226  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.91 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 290 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  48.31 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  47.28 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.64 
 
 		 259 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.27 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  46.22 
 
 		 265 aa  226  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.74 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50.45 
 
 		 261 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.44 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 		 281 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.62 
 
 		 273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.8 
 
 		 287 aa  225  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  44.63 
 
 		 306 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.37 
 
 		 272 aa  225  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.33 
 
 		 255 aa  224  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.15 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.99 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.08 
 
 		 257 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  47.23 
 
 		 266 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  46.84 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.62 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  46.84 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  48.47 
 
 		 275 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.96 
 
 		 267 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  44.49 
 
 		 284 aa  222  4e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  45.99 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  47.26 
 
 		 263 aa  222  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>