More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0332 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
267 aa  534  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  83.9 
 
 
268 aa  441  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  70.98 
 
 
267 aa  362  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  69.92 
 
 
271 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  66.04 
 
 
270 aa  349  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  66.8 
 
 
276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  66.67 
 
 
267 aa  334  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  58.33 
 
 
267 aa  291  9e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  59.2 
 
 
266 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  58.87 
 
 
266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  60.08 
 
 
269 aa  279  3e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.55 
 
 
276 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  57.03 
 
 
274 aa  270  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  55.38 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  59.17 
 
 
252 aa  266  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  55.56 
 
 
261 aa  265  5.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  58.4 
 
 
246 aa  263  2e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.75 
 
 
257 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  51.22 
 
 
252 aa  263  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  52.26 
 
 
284 aa  262  4.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.03 
 
 
324 aa  260  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  53.53 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  53.17 
 
 
277 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  53.04 
 
 
284 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  57.32 
 
 
259 aa  250  2e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  50.79 
 
 
304 aa  249  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  55.92 
 
 
246 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  50 
 
 
306 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.42 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  50 
 
 
299 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.37 
 
 
278 aa  226  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
268 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  53.3 
 
 
233 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  48.03 
 
 
258 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  45.63 
 
 
258 aa  218  6e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 
259 aa  218  7e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  48.03 
 
 
261 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.67 
 
 
274 aa  218  7.999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.31 
 
 
281 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.46 
 
 
254 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.68 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  49.58 
 
 
263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  46.22 
 
 
260 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.06 
 
 
254 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.66 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.06 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  48.73 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.28 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.02 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  47.35 
 
 
272 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  53.67 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  57.21 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.48 
 
 
259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.18 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  57.21 
 
 
284 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  46.81 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.73 
 
 
284 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  48.18 
 
 
333 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.25 
 
 
265 aa  211  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.1 
 
 
262 aa  210  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.22 
 
 
278 aa  210  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.53 
 
 
259 aa  209  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  44.05 
 
 
262 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.22 
 
 
261 aa  207  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  44.4 
 
 
259 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  45.57 
 
 
259 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.32 
 
 
275 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  44.71 
 
 
299 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.58 
 
 
276 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
291 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.01 
 
 
255 aa  205  5e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  43.57 
 
 
261 aa  205  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  48.29 
 
 
269 aa  205  7e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  47.3 
 
 
264 aa  205  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.28 
 
 
252 aa  204  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  47.88 
 
 
278 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.84 
 
 
252 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  47.84 
 
 
252 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.23 
 
 
274 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.95 
 
 
264 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  46.12 
 
 
263 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.34 
 
 
330 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  47.51 
 
 
261 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.61 
 
 
271 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
273 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
261 aa  202  5e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 
260 aa  201  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.7 
 
 
255 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  44.18 
 
 
259 aa  201  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
278 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.82 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  46.43 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.41 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.64 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  48.73 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.97 
 
 
267 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.15 
 
 
274 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.13 
 
 
244 aa  199  3e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>