More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2544 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  100 
 
 		 269 aa  550  1e-155  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  73.49 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  73.49 
 
 		 271 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.45 
 
 		 281 aa  271  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  50.8 
 
 		 259 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  49.43 
 
 		 271 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  51.65 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50 
 
 		 276 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  52.77 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.18 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  52.21 
 
 		 257 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  51.03 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.95 
 
 		 299 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  49.8 
 
 		 278 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  51.33 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  49.21 
 
 		 273 aa  231  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.02 
 
 		 275 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.11 
 
 		 262 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  46.03 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.77 
 
 		 284 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.79 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  47.2 
 
 		 260 aa  226  4e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  47.01 
 
 		 275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 272 aa  222  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.16 
 
 		 265 aa  221  8e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  47.95 
 
 		 255 aa  221  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.72 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  43.88 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  46.5 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.85 
 
 		 265 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  45.61 
 
 		 280 aa  217  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.15 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  44.77 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  44.78 
 
 		 263 aa  215  5e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 281 aa  215  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.37 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.9 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  47.32 
 
 		 286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0131  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  48.89 
 
 		 281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  46.91 
 
 		 262 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  45.88 
 
 		 269 aa  212  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 		 281 aa  212  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  41.35 
 
 		 290 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  45.23 
 
 		 244 aa  212  5.999999999999999e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.88 
 
 		 258 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  45.24 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  44.26 
 
 		 284 aa  211  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  46.44 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.35 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.49 
 
 		 269 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.94 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4347  ABC transporter related  44.66 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4019  ABC transporter related  44.66 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3505  ABC transporter related  44.27 
 
 		 281 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870495  hitchhiker  0.000930317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2157  sulfate ester ABC transporter ATPase  45.27 
 
 		 288 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0499335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  46.43 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  41.31 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  41.96 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  44.53 
 
 		 278 aa  208  9e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.57 
 
 		 261 aa  208  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  47.92 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.83 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  44.35 
 
 		 307 aa  206  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  45.74 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.05 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  42.11 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  46.19 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.57 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.09 
 
 		 291 aa  205  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  45.31 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  42.62 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.53 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.44 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2064  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.87 
 
 		 281 aa  202  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.768493  normal  0.657795 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 263 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.12 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.8 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  44.12 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  47.22 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  43.09 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.44 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 426 aa  202  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.23 
 
 		 276 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4565  ABC transporter related  44.63 
 
 		 281 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  43.85 
 
 		 267 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0164  ABC transporter related  43.67 
 
 		 275 aa  201  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  42.42 
 
 		 262 aa  201  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0590  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 263 aa  201  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.15 
 
 		 255 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  44.94 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.64 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>