More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1394 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  100 
 
 
267 aa  549  1e-155  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  53.44 
 
 
281 aa  308  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  52.87 
 
 
286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  53.67 
 
 
280 aa  300  2e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  52.51 
 
 
272 aa  295  4e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  53.28 
 
 
274 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  52.53 
 
 
284 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  53.12 
 
 
260 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  49.62 
 
 
287 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.92 
 
 
281 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  46.43 
 
 
266 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  47.21 
 
 
262 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  45.02 
 
 
298 aa  228  7e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  44.78 
 
 
297 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.03 
 
 
269 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  43.78 
 
 
271 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  46.22 
 
 
259 aa  226  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  50 
 
 
258 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  43.28 
 
 
271 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  45.06 
 
 
262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.15 
 
 
257 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  44.27 
 
 
271 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.97 
 
 
284 aa  217  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  43.98 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.3 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  43.6 
 
 
267 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.6 
 
 
278 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  42.11 
 
 
254 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  44.02 
 
 
254 aa  205  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.23 
 
 
258 aa  205  5e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.28 
 
 
254 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.41 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.53 
 
 
275 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  38.96 
 
 
275 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  41.53 
 
 
276 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.97 
 
 
278 aa  202  6e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.92 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.41 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  42.28 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  42.61 
 
 
311 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.34 
 
 
283 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
254 aa  195  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
311 aa  195  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  39.69 
 
 
276 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  41.39 
 
 
286 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.07 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  39.93 
 
 
297 aa  194  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  40.82 
 
 
291 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  39.25 
 
 
272 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  42.13 
 
 
284 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3115  ABC transporter related  40.86 
 
 
272 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.200151  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  42.8 
 
 
286 aa  193  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  44.44 
 
 
244 aa  194  2e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.02 
 
 
244 aa  193  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
256 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
268 aa  192  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  42.61 
 
 
311 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  42.35 
 
 
285 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  42.74 
 
 
246 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  40.71 
 
 
263 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  39.63 
 
 
250 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.55 
 
 
263 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  38.87 
 
 
272 aa  191  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  40.43 
 
 
246 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  41.45 
 
 
274 aa  191  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  40.23 
 
 
275 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0147  ABC transporter related  40 
 
 
273 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  42.8 
 
 
267 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  42.06 
 
 
253 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  40.89 
 
 
285 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  42.29 
 
 
288 aa  190  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.31 
 
 
277 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.5 
 
 
273 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  40.7 
 
 
278 aa  189  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  42.8 
 
 
259 aa  189  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  40.77 
 
 
267 aa  189  5e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.73 
 
 
276 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  40 
 
 
252 aa  189  5e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  42.23 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  40.08 
 
 
313 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  39.84 
 
 
278 aa  188  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0036  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
265 aa  188  7e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  38.4 
 
 
255 aa  188  7e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2679  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  40.29 
 
 
285 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1854  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.812783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0039  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
265 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0252  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
288 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.616609  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2698  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
288 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  40.23 
 
 
288 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  39.37 
 
 
299 aa  188  1e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  42.11 
 
 
261 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  44.44 
 
 
258 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  40.76 
 
 
259 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  40.85 
 
 
251 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  41.5 
 
 
252 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1667  ABC transporter related  43.23 
 
 
260 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0642211  normal  0.357453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>