More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0621 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  561  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  51.6 
 
 		 254 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  46.22 
 
 		 274 aa  225  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  47.74 
 
 		 271 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  51.3 
 
 		 268 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  49.38 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  53.52 
 
 		 257 aa  216  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49.78 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  46.41 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  53.52 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  46.78 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.18 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  47.23 
 
 		 271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  44.4 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  48.51 
 
 		 251 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.42 
 
 		 324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.92 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.76 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50.95 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.28 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  46.51 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  53.05 
 
 		 330 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4077  ABC transporter related protein  54.27 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  47.16 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  51.2 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.34 
 
 		 258 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.35 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.81 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  46.09 
 
 		 269 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.3 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  50.7 
 
 		 280 aa  206  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.52 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.83 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  44.31 
 
 		 246 aa  205  7e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  48.39 
 
 		 278 aa  205  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  46.64 
 
 		 244 aa  205  8e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  47.08 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  46.15 
 
 		 266 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  51.01 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  48.25 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  46.42 
 
 		 262 aa  202  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 281 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.16 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  41.53 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.68 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.29 
 
 		 265 aa  201  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  50 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  46.67 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.72 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1530  ABC transporter related  47.79 
 
 		 285 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.76 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  47.66 
 
 		 263 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  46.7 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  43.04 
 
 		 286 aa  199  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  48.11 
 
 		 273 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  45.97 
 
 		 262 aa  198  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  47.08 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 272 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.64 
 
 		 246 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0116  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.72 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  46.81 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.68 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  45.02 
 
 		 261 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  43.48 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.6 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50.93 
 
 		 284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.98 
 
 		 252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.67 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  50.94 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.25 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  47.13 
 
 		 275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.54 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  48.56 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  46.7 
 
 		 307 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.91 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.5 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  53.06 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  43.62 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  46.75 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.06 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.57 
 
 		 262 aa  196  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  53.57 
 
 		 284 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  44.44 
 
 		 283 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  43.95 
 
 		 245 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  48.71 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.33 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  46.32 
 
 		 263 aa  195  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2164  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.3 
 
 		 276 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.47 
 
 		 304 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  44.87 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  43.55 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  43.09 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.45 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>