More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1090 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  100 
 
 		 261 aa  532  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  54.8 
 
 		 267 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  56.86 
 
 		 266 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  59.6 
 
 		 257 aa  278  5e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  55.86 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  56.69 
 
 		 276 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  55.47 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  57.03 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  56 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  54.09 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  57.14 
 
 		 271 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  50.59 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  51.17 
 
 		 274 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.78 
 
 		 324 aa  263  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  53.75 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  54.98 
 
 		 270 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  51.38 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  52.4 
 
 		 277 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  54.55 
 
 		 259 aa  249  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  51.19 
 
 		 276 aa  246  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  51.59 
 
 		 284 aa  246  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  49.6 
 
 		 284 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  48.24 
 
 		 282 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  47.89 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  47.89 
 
 		 304 aa  236  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  49.8 
 
 		 246 aa  235  7e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  47.13 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  50.21 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.6 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.75 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  48.84 
 
 		 258 aa  206  4e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.18 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.81 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  46.27 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.49 
 
 		 281 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45.2 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.5 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 261 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  45.02 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.38 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.13 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 273 aa  196  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.46 
 
 		 306 aa  195  6e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  195  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  43.55 
 
 		 283 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.8 
 
 		 265 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  41.02 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  42 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.19 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 278 aa  192  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.77 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  48.18 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  45.99 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  44.96 
 
 		 426 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  44.27 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  40.39 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.31 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.02 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  45.73 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  40.16 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0014  ABC transporter related  42.62 
 
 		 245 aa  191  1e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  39.37 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  41.67 
 
 		 260 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.74 
 
 		 284 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  40.98 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  41.57 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  43.48 
 
 		 289 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 251 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  41 
 
 		 275 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  40.93 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  42.97 
 
 		 259 aa  188  5.999999999999999e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  41.5 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 278 aa  188  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  39.53 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  44.58 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  40.32 
 
 		 258 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  44.53 
 
 		 259 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  40.47 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  40 
 
 		 333 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  40.7 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  41.09 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  44.18 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0455  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.15 
 
 		 287 aa  186  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  44.92 
 
 		 278 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.33 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1261  ABC transporter related  43.78 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192421  normal  0.0152402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.43 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  45.11 
 
 		 259 aa  185  7e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  43.4 
 
 		 260 aa  185  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  45.96 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  38.19 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  42.73 
 
 		 246 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.67 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.62 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>