More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3413 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  100 
 
 		 259 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  57.47 
 
 		 266 aa  298  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.36 
 
 		 266 aa  288  8e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  56.97 
 
 		 252 aa  265  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  54.55 
 
 		 261 aa  261  8.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  57.32 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  56.63 
 
 		 267 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  57.98 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  53.17 
 
 		 274 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  55.75 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  52.03 
 
 		 269 aa  255  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  57.66 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  53.33 
 
 		 324 aa  252  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  56.85 
 
 		 257 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  56.38 
 
 		 270 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  51.78 
 
 		 267 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  52.87 
 
 		 276 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  56.33 
 
 		 271 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  53.09 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  47.35 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.02 
 
 		 276 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  48.62 
 
 		 274 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 282 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.03 
 
 		 277 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  54.46 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  44.31 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  44.31 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  43.92 
 
 		 306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  47.64 
 
 		 284 aa  208  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.02 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.09 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  47.58 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  49.15 
 
 		 297 aa  198  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.15 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  45.56 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1261  ABC transporter related  50.83 
 
 		 257 aa  196  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192421  normal  0.0152402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  49.31 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  44.63 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  46.4 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  50.25 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  49.51 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4138  ABC transporter (ATP-binding protein)  45.9 
 
 		 279 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.285064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 267 aa  194  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  44.67 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.74 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  47.71 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.91 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  49.32 
 
 		 260 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.5 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.86 
 
 		 278 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  42.06 
 
 		 283 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.97 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  47.98 
 
 		 258 aa  192  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  44.69 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.45 
 
 		 291 aa  191  7e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  43.8 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  49.77 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  45.61 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.3 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  46.46 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.8 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  47.69 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.89 
 
 		 289 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5059  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.89 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.49 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  45.2 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  48.04 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3602  ABC transporter related  44.78 
 
 		 279 aa  188  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  43.14 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  45.18 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.53 
 
 		 284 aa  188  9e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  45.18 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.5 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  43.18 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  47.69 
 
 		 261 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1729  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 265 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  46.46 
 
 		 336 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  44.84 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.97 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  49.08 
 
 		 245 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.54 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  47.29 
 
 		 239 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  41.33 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.06 
 
 		 260 aa  186  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5197  ABC transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 286 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6249  ABC transporter related  46.02 
 
 		 313 aa  185  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.532936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.5 
 
 		 275 aa  185  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  49.51 
 
 		 306 aa  185  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.54 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  43.48 
 
 		 282 aa  184  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  47.49 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  46.12 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  47.49 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.54 
 
 		 278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>