More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0571 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  537  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  71.88 
 
 		 270 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  73.33 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  72.54 
 
 		 276 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  69.92 
 
 		 267 aa  352  4e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  69.26 
 
 		 268 aa  351  8e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  71.43 
 
 		 267 aa  350  8.999999999999999e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  58.06 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  57.77 
 
 		 266 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  55.47 
 
 		 274 aa  279  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  60.67 
 
 		 276 aa  278  8e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  57.77 
 
 		 324 aa  275  5e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  54.17 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  57.61 
 
 		 266 aa  271  8.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  57.14 
 
 		 261 aa  267  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  58.96 
 
 		 257 aa  261  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  53.44 
 
 		 276 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  55 
 
 		 269 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  50 
 
 		 252 aa  256  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  54.29 
 
 		 284 aa  255  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  55.14 
 
 		 252 aa  254  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.19 
 
 		 282 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  55.14 
 
 		 246 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.38 
 
 		 277 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  50.2 
 
 		 284 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  50.99 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  56.33 
 
 		 259 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  45.91 
 
 		 306 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  45.91 
 
 		 304 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  46.03 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.48 
 
 		 271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  45.7 
 
 		 271 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  52.29 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.96 
 
 		 271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  47.01 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1261  ABC transporter related  54.35 
 
 		 257 aa  209  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.192421  normal  0.0152402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.43 
 
 		 278 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  48.8 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.79 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  48.8 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  48.8 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  48.68 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5800  ABC transporter related  44.06 
 
 		 284 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.78 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.1 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  51.63 
 
 		 261 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.57 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  51.02 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.11 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  51.02 
 
 		 263 aa  202  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  50.43 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  51.8 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.91 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2815  ABC transporter related  44.18 
 
 		 241 aa  202  6e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000485223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  49.37 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  50.66 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  50.66 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  48.36 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.58 
 
 		 261 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  51.8 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  48.36 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  49.79 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  48.88 
 
 		 259 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  48.75 
 
 		 262 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  50.51 
 
 		 333 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  199  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  52.53 
 
 		 257 aa  199  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  43.9 
 
 		 263 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  51.71 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.67 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  46.22 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.43 
 
 		 254 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  48.8 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.07 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  44.03 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.15 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  51.89 
 
 		 284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  43.48 
 
 		 272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.15 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  45.45 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.13 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  44.31 
 
 		 278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.89 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  48.47 
 
 		 263 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 		 272 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 275 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.89 
 
 		 330 aa  195  5.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  51.42 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  51.42 
 
 		 284 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  42.57 
 
 		 276 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 261 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  41.43 
 
 		 255 aa  195  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  41.74 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>