More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3339 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  75.59 
 
 
259 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  74.9 
 
 
259 aa  371  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  75.3 
 
 
259 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  70.77 
 
 
260 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  64.46 
 
 
261 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  59.7 
 
 
261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  62.55 
 
 
252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  60.49 
 
 
245 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2893  ABC transporter related  63.37 
 
 
259 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0779  ABC transporter related  59.84 
 
 
249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.55 
 
 
245 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  50.83 
 
 
260 aa  223  3e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  48.78 
 
 
253 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  52.1 
 
 
268 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1572  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.64 
 
 
258 aa  218  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  54.59 
 
 
255 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  50.42 
 
 
274 aa  217  1e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  46.49 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  45.9 
 
 
260 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  51.58 
 
 
245 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0209  ABC transporter-like  46.25 
 
 
271 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  48.93 
 
 
263 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.09 
 
 
283 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  47.32 
 
 
246 aa  211  7e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0150  ABC transporter related  49.56 
 
 
252 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  46.79 
 
 
286 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  48.2 
 
 
261 aa  211  1e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  46.86 
 
 
278 aa  211  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2623  ABC transporter related  43.93 
 
 
255 aa  210  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000578325  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
254 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  46.02 
 
 
252 aa  209  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  47.97 
 
 
262 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  48.87 
 
 
276 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  47.11 
 
 
267 aa  209  3e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1919  ABC transporter related  42.8 
 
 
265 aa  209  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.09 
 
 
254 aa  209  4e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.76 
 
 
251 aa  209  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  48.21 
 
 
287 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  48.54 
 
 
274 aa  208  8e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1431  ABC transporter related  44.84 
 
 
269 aa  208  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.242163  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.19 
 
 
252 aa  208  9e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  46.75 
 
 
267 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4335  ABC transporter related protein  48.23 
 
 
247 aa  207  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.94 
 
 
259 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2311  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 
251 aa  206  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.89952  hitchhiker  0.0000000038093 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  43.5 
 
 
262 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  46.5 
 
 
269 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  41.98 
 
 
254 aa  206  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.77 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.77 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0264  ABC transporter ATP-binding protein  51.92 
 
 
279 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  50 
 
 
272 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  50.22 
 
 
284 aa  205  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1831  ABC transporter related protein  44.36 
 
 
266 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.39 
 
 
254 aa  205  6e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.86 
 
 
272 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  44.4 
 
 
251 aa  204  8e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02330  ABC transporter ATP-binding protein  51.92 
 
 
279 aa  204  8e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.366752  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  47.58 
 
 
307 aa  204  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2932  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
251 aa  204  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.28 
 
 
260 aa  204  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  48 
 
 
269 aa  204  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0230  ABC transporter related  48 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.32 
 
 
271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.2 
 
 
254 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  47.51 
 
 
271 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.75 
 
 
260 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2665  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  40.5 
 
 
251 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.273275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2642  alkanesulfonates transport ATP-binding protein  40.91 
 
 
251 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7233  ABC transporter related  45.24 
 
 
285 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.373776  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.53 
 
 
264 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  45.93 
 
 
259 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1236  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  46.72 
 
 
274 aa  202  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2968  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
251 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.503094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5006  ABC transporter related  50.72 
 
 
287 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  52.38 
 
 
297 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2961  sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.49 
 
 
251 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0749803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  45.96 
 
 
285 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  50.21 
 
 
255 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  48.58 
 
 
239 aa  202  6e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  45.42 
 
 
253 aa  202  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2714  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 
287 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0521621  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.91 
 
 
258 aa  201  8e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  48 
 
 
255 aa  201  9e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2922  sulfonate ABC transporter ATP-binding protein  40.5 
 
 
251 aa  201  9e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.900883  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
271 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2921  putative sulfonate ABC transporter, ATP-binding protein  40.5 
 
 
251 aa  201  9e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.88235e-19 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  41.87 
 
 
251 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  45.76 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  49.37 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0677  ABC transporter related  44.9 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.28609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  49.03 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  43.53 
 
 
256 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  50.23 
 
 
264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  43.59 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0528  ABC transporter related  42.67 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  50.49 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  45.98 
 
 
289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>