More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3141 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  100 
 
 
233 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  59.05 
 
 
274 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  60.18 
 
 
257 aa  240  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  55.41 
 
 
254 aa  237  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  53.16 
 
 
267 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  51.93 
 
 
267 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  49.79 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  48.32 
 
 
276 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  52.12 
 
 
270 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  53.81 
 
 
288 aa  221  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  53.3 
 
 
267 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  51.93 
 
 
306 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  51.5 
 
 
304 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  51.5 
 
 
299 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  51.32 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  49.36 
 
 
262 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  49.79 
 
 
284 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  48.93 
 
 
278 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  48.28 
 
 
276 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  46.09 
 
 
274 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.93 
 
 
261 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  51.27 
 
 
284 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  51.27 
 
 
284 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50.42 
 
 
289 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  46.81 
 
 
263 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  48.68 
 
 
271 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  44.49 
 
 
252 aa  206  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.12 
 
 
267 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  53.15 
 
 
291 aa  205  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  47.62 
 
 
269 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  45.38 
 
 
282 aa  204  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  44.02 
 
 
267 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  46.09 
 
 
287 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  46.96 
 
 
276 aa  201  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  44.96 
 
 
284 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  45.49 
 
 
333 aa  201  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  45.96 
 
 
263 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  46.98 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  44.64 
 
 
261 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  45.65 
 
 
274 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.92 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.34 
 
 
272 aa  198  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.53 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  44.68 
 
 
258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.35 
 
 
275 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  46.55 
 
 
266 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  43.97 
 
 
255 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  46.52 
 
 
266 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.15 
 
 
278 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
268 aa  194  7e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  48.48 
 
 
261 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  52.63 
 
 
330 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  44.1 
 
 
261 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.44 
 
 
261 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  43.51 
 
 
252 aa  194  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.59 
 
 
276 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  44.74 
 
 
265 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  46.35 
 
 
266 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  46.67 
 
 
264 aa  192  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  45.31 
 
 
264 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  42.74 
 
 
259 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  41.92 
 
 
261 aa  192  5e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  45.73 
 
 
255 aa  192  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.89 
 
 
267 aa  191  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  43.44 
 
 
259 aa  191  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.75 
 
 
297 aa  190  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  50.48 
 
 
277 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  42.32 
 
 
259 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  41.63 
 
 
260 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.08 
 
 
278 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  45.06 
 
 
265 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.98 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  45.76 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
260 aa  189  4e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.98 
 
 
252 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.98 
 
 
252 aa  189  4e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.49 
 
 
278 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  43.62 
 
 
271 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.53 
 
 
259 aa  187  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  43.27 
 
 
260 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  45.23 
 
 
260 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  42.51 
 
 
259 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.56 
 
 
258 aa  186  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  50 
 
 
257 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  48.05 
 
 
274 aa  186  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.15 
 
 
260 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  41.22 
 
 
259 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  45.65 
 
 
278 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  41.41 
 
 
261 aa  185  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  45.06 
 
 
284 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  45.78 
 
 
246 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.61 
 
 
264 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  47.3 
 
 
275 aa  184  7e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.14 
 
 
289 aa  184  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.14 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  42.86 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  41.96 
 
 
262 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.16 
 
 
267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>