More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3789 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3789  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0962243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  74.9 
 
 		 274 aa  357  8e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  57.43 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4057  ABC transporter related  55.83 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  55.41 
 
 		 233 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.53 
 
 		 267 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  216  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  50.65 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  43.61 
 
 		 284 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  48.72 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  46.51 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.51 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  46.43 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.49 
 
 		 276 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  48.25 
 
 		 276 aa  205  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  43.36 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  47.54 
 
 		 268 aa  204  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.08 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  46.51 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.81 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.89 
 
 		 253 aa  203  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.43 
 
 		 284 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.91 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 256 aa  202  6e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  41.96 
 
 		 266 aa  201  9e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  47.96 
 
 		 263 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  42.64 
 
 		 282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.31 
 
 		 324 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  46.72 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  49.13 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  47.81 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  47.13 
 
 		 268 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  45.1 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.58 
 
 		 265 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  48.25 
 
 		 246 aa  198  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.54 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50 
 
 		 284 aa  198  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.22 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.34 
 
 		 253 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  43.03 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  45.49 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  44.12 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  48.95 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  45.83 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.05 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  44.27 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.06 
 
 		 288 aa  195  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  44.31 
 
 		 306 aa  195  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  46.72 
 
 		 333 aa  195  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  41.7 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  44.31 
 
 		 304 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50 
 
 		 291 aa  194  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.94 
 
 		 278 aa  194  9e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 		 260 aa  194  9e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.1 
 
 		 261 aa  194  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  44.05 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  40.4 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  44.63 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.45 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  42.13 
 
 		 271 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  46.22 
 
 		 264 aa  192  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.25 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  43.85 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.23 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  45.7 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 272 aa  191  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.22 
 
 		 273 aa  191  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1220  ABC transporter related protein  42.34 
 
 		 262 aa  191  8e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  48.64 
 
 		 265 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.47 
 
 		 330 aa  191  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  43.51 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  42.74 
 
 		 245 aa  190  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  43.95 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  42.15 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 		 263 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  46.09 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  43.83 
 
 		 259 aa  190  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  42.73 
 
 		 258 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  44.81 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  40.4 
 
 		 275 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.07 
 
 		 256 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.92 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  48.06 
 
 		 278 aa  189  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  44.22 
 
 		 265 aa  189  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  49.58 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  44.78 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3116  ABC transporter related  45.57 
 
 		 241 aa  188  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.31 
 
 		 263 aa  188  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.91 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  44.68 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  49.76 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.04 
 
 		 282 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>