More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2575 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  100 
 
 
282 aa  554  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  65.2 
 
 
291 aa  314  9e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  60 
 
 
330 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  53.78 
 
 
261 aa  275  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  55.19 
 
 
278 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  53.88 
 
 
289 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  55.97 
 
 
284 aa  261  6.999999999999999e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  55.56 
 
 
284 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  50.79 
 
 
266 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  49.01 
 
 
263 aa  252  6e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  49.23 
 
 
333 aa  250  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  48.08 
 
 
265 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  54.39 
 
 
268 aa  248  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  50.2 
 
 
262 aa  247  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  54.31 
 
 
274 aa  245  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  47.93 
 
 
263 aa  241  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  47.93 
 
 
258 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.93 
 
 
261 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  49.44 
 
 
276 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  46.8 
 
 
272 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  48.13 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  49.42 
 
 
273 aa  233  4.0000000000000004e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
281 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  48.19 
 
 
261 aa  227  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.9 
 
 
278 aa  226  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48 
 
 
254 aa  225  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  49.4 
 
 
259 aa  225  8e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  49.79 
 
 
265 aa  224  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  51.52 
 
 
259 aa  223  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  48.99 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.4 
 
 
284 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  52.94 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  46.9 
 
 
269 aa  220  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  48.45 
 
 
276 aa  219  5e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  50.84 
 
 
246 aa  216  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.09 
 
 
278 aa  217  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.8 
 
 
259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42.21 
 
 
258 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  46.06 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3410  ABC transporter related  51.76 
 
 
275 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0325873 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  47.43 
 
 
266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.91 
 
 
273 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  50.39 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.12 
 
 
284 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  44.44 
 
 
255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  46.74 
 
 
282 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46 
 
 
257 aa  211  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  45.28 
 
 
261 aa  211  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  46.48 
 
 
299 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  50.6 
 
 
246 aa  210  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.06 
 
 
288 aa  210  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  44.05 
 
 
263 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.75 
 
 
269 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  52.34 
 
 
275 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  47.08 
 
 
263 aa  208  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  44.2 
 
 
254 aa  208  9e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3113  ABC transporter related  47.35 
 
 
283 aa  207  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0374079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
261 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.36 
 
 
256 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.49 
 
 
278 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  50.21 
 
 
297 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.8 
 
 
259 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  48.12 
 
 
264 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  46.75 
 
 
275 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.66 
 
 
292 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  46.21 
 
 
284 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
256 aa  207  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.78 
 
 
258 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.2 
 
 
267 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.69 
 
 
271 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.85 
 
 
253 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.64 
 
 
274 aa  206  3e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  48.22 
 
 
259 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  44.83 
 
 
272 aa  206  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  43.61 
 
 
274 aa  205  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.39 
 
 
254 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.81 
 
 
260 aa  205  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  46.72 
 
 
274 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45.14 
 
 
262 aa  205  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  48.95 
 
 
267 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.8 
 
 
276 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  48.9 
 
 
257 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  40.75 
 
 
307 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.58 
 
 
263 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.95 
 
 
254 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  45 
 
 
262 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  46.55 
 
 
253 aa  203  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
260 aa  203  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 
278 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  44.75 
 
 
259 aa  203  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.72 
 
 
260 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  41.26 
 
 
254 aa  203  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  45 
 
 
280 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.09 
 
 
276 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.91 
 
 
301 aa  201  9e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.74 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  44.2 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.15 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  43.73 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.56 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.511865 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>