More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02140 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 272 aa  555  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2282  ABC transporter related  51.54 
 
 		 271 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000447815  unclonable  0.000000000246868 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14760  ABC transporter related  46.38 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.08 
 
 		 280 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0353  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  42.96 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  47.72 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.48 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  41.5 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.5 
 
 		 254 aa  212  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  42.98 
 
 		 271 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.55 
 
 		 254 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  42.37 
 
 		 272 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.7 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  42.27 
 
 		 254 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.69 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0098  ABC transporter related  47.7 
 
 		 246 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.8 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  45.95 
 
 		 270 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  43.98 
 
 		 297 aa  206  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  45.5 
 
 		 254 aa  206  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.2 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  41.55 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  42.91 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  45.8 
 
 		 257 aa  204  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  49.77 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  46.98 
 
 		 259 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 265 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.77 
 
 		 288 aa  202  5e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5603  ABC transporter related protein  38.55 
 
 		 263 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 264 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  40 
 
 		 270 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.47 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  37.5 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.25 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  45.07 
 
 		 263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  44.54 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  43.25 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  47.26 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.83 
 
 		 251 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  44.14 
 
 		 271 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5154  ABC transporter related  49.07 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.597589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.95 
 
 		 271 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  43.56 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  41.83 
 
 		 259 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  45.33 
 
 		 287 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  41.13 
 
 		 284 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  47.2 
 
 		 260 aa  198  9e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  43.6 
 
 		 286 aa  198  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.05 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.53 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  40.23 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  46.4 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  43.56 
 
 		 293 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2951  ABC transporter, ATP-binding protein  41.97 
 
 		 435 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  45.78 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  45.21 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  42.37 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  43.56 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1352  ABC transporter related  41.76 
 
 		 262 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  47.91 
 
 		 265 aa  196  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.03 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4457  ABC transporter related  46.55 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0721203  normal  0.624279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4591  ABC transporter related  46.55 
 
 		 265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  46.58 
 
 		 263 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4338  ABC transporter related  47 
 
 		 271 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1581  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132278  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0621  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00429609  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2018  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.828893  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2221  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.893896  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0696  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  42.69 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  46.33 
 
 		 262 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.13 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  44.6 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  45.24 
 
 		 291 aa  194  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.27 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.16 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  43.08 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  48.11 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2884  ABC transporter related  44.39 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.2 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2134  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  44.26 
 
 		 260 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841384  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.39 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2000  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.554575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 440 aa  193  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4149  ABC transporter related  45.18 
 
 		 266 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0621662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4114  ABC transporter related  47 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4252  ABC transporter related  47 
 
 		 273 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0391855  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3676  ABC transporter related  45.18 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.01 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  49.49 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  42.13 
 
 		 445 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>