More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2032 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  100 
 
 		 278 aa  541  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 		 282 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  47.68 
 
 		 284 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  47.77 
 
 		 252 aa  212  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  48.59 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  48.05 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  48.05 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.31 
 
 		 324 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  47.81 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.08 
 
 		 330 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  48.92 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.62 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  47.3 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  44.57 
 
 		 264 aa  203  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.17 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  50.39 
 
 		 282 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  48.55 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.71 
 
 		 277 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.92 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  45.93 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  43.08 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  49.16 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  45.93 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  45.53 
 
 		 244 aa  199  5e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  43.37 
 
 		 244 aa  198  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  42.41 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  40.77 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  43.87 
 
 		 276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.26 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  46.64 
 
 		 259 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  44.03 
 
 		 263 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.8 
 
 		 281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  48.91 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  43.15 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.69 
 
 		 280 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  44.74 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  48.47 
 
 		 284 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  45 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  46.9 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.32 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  45.78 
 
 		 261 aa  192  4e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.98 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  44.14 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  45.63 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  43.14 
 
 		 262 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  44.05 
 
 		 266 aa  191  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.08 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  41.49 
 
 		 284 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0768  ABC transporter, conserved site  41.77 
 
 		 432 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44 
 
 		 262 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  42.73 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  41.83 
 
 		 262 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  46.3 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  44.05 
 
 		 333 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  40.6 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  41.13 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  45.08 
 
 		 233 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3666  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.844383  normal  0.10889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  45.35 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  42.45 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  41.42 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.04 
 
 		 262 aa  188  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  42.48 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  46.1 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.92 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  43.03 
 
 		 261 aa  188  8e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  43.45 
 
 		 266 aa  188  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  41.27 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1104  ABC transporter related protein  41.02 
 
 		 426 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.770233  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  43.56 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0816  ABC transporter related  42.17 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.117233  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  40.6 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  47.93 
 
 		 265 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.93 
 
 		 288 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0667  ABC transporter related  42.59 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  44.75 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4848  Sigma 54 interacting domain protein  44.31 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.627338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4372  ABC transporter related  44.31 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.191075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  42.5 
 
 		 271 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.53 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  47.97 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  46.38 
 
 		 263 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  43.98 
 
 		 287 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.27 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  45.99 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  48.12 
 
 		 262 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  45.41 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.45 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  42.62 
 
 		 286 aa  185  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  43.14 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3277  translation initiation factor IF-2  42.8 
 
 		 261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00123612  normal  0.0327391 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2118  ABC transporter related protein  38.26 
 
 		 250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  43.04 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2775  ABC transporter related  47.66 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>