More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34330  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  100 
 
 		 262 aa  533  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5421  ABC transporter related  73.54 
 
 		 294 aa  363  2e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1817  ABC transporter  65.76 
 
 		 261 aa  341  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1802  ABC transporter related protein  63.46 
 
 		 267 aa  331  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00421209  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2480  ABC transporter related protein  57.6 
 
 		 263 aa  293  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5351  ABC transporter related  57.14 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  59.59 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5440  ABC transporter related  57.14 
 
 		 262 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  58.78 
 
 		 267 aa  290  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5730  ABC transporter related  56.61 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  57.79 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  47.95 
 
 		 278 aa  228  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  46.4 
 
 		 291 aa  228  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3541  ABC transporter related  44.22 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774244  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.86 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.86 
 
 		 303 aa  222  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.86 
 
 		 303 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.24 
 
 		 304 aa  218  6e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.8 
 
 		 286 aa  218  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  47.21 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.84 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 308 aa  214  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.9 
 
 		 283 aa  214  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  44.84 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5983  ABC transporter ATP-binding protein  45.81 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.289741 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  45.27 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.34 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  41.53 
 
 		 257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0104  ABC transporter related  46.12 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464024  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  44.18 
 
 		 253 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  45.06 
 
 		 259 aa  210  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  43.2 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.77 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  44 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  42.4 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  43.35 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0147  ABC transporter related  43.02 
 
 		 259 aa  208  7e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  42.25 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  47.27 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.67 
 
 		 262 aa  208  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  44.98 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.44 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.75 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.38 
 
 		 292 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  43.67 
 
 		 254 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.22 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2643  ABC transporter related  46.9 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.430112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.29 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  42 
 
 		 264 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.67 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0667  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.67 
 
 		 266 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.024802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43.6 
 
 		 273 aa  204  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.69 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.6 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  47.64 
 
 		 254 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 271 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  44.44 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  47.22 
 
 		 269 aa  202  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.35 
 
 		 271 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0384  ABC transporter related  42.97 
 
 		 288 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.323719 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  42.86 
 
 		 259 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.4 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  46.35 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  45.37 
 
 		 313 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  45.41 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  42.05 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  42.04 
 
 		 259 aa  201  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  45.85 
 
 		 288 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.35 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  42.35 
 
 		 252 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  44.86 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  44.03 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  43.27 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  40.71 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  43.8 
 
 		 269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.57 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  41.06 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  40.61 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.09 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  45.13 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  44.18 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  40.98 
 
 		 266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0175  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  38.74 
 
 		 286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.482703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1270  ABC transporter related  45.96 
 
 		 447 aa  199  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2323  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.16 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  43.68 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  44.58 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2961  ABC transporter related  42.98 
 
 		 271 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0491364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.53 
 
 		 280 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5516  ABC transporter related  41.18 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7248  ABC transporter ATP-binding protein  46.76 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00375076  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5128  ABC transporter related  45.23 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.012319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  41.6 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  45.73 
 
 		 264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0996963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>