More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3757 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  100 
 
 
260 aa  530  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1096  ABC transporter-related protein  64.32 
 
 
272 aa  333  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.689676 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  60.17 
 
 
286 aa  321  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1139  ABC transporter related  61.41 
 
 
280 aa  318  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.573194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2128  ABC transporter related  57.47 
 
 
284 aa  315  6e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.249776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0393  ABC transporter-related protein  62.76 
 
 
281 aa  314  7e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00688519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1092  ABC transporter-related protein  61.41 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.44747  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3605  ABC transporter related  55.98 
 
 
287 aa  290  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.475451  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  53.12 
 
 
267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2974  ABC transporter related  50.19 
 
 
262 aa  246  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0639393 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  48.28 
 
 
266 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2600  ABC transporter related  48.46 
 
 
298 aa  237  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  47.79 
 
 
284 aa  236  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0941  ABC transporter, ATPase subunit  48.46 
 
 
297 aa  237  2e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  46.43 
 
 
259 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.41 
 
 
259 aa  235  4e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  44.53 
 
 
271 aa  232  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  48.22 
 
 
275 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.38 
 
 
281 aa  227  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  47.2 
 
 
269 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.78 
 
 
278 aa  225  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  47.86 
 
 
271 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 
271 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.71 
 
 
271 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  44.88 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.42 
 
 
254 aa  219  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  45.35 
 
 
262 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.36 
 
 
258 aa  218  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  49.57 
 
 
257 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  46.42 
 
 
273 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  42.17 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 
261 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  44.31 
 
 
267 aa  210  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  43.13 
 
 
267 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.44 
 
 
276 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  45.69 
 
 
304 aa  208  9e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.61 
 
 
280 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  43.92 
 
 
291 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  43.53 
 
 
267 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  44.14 
 
 
278 aa  205  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  43.02 
 
 
253 aa  205  5e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  40.96 
 
 
262 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.47 
 
 
297 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  41.74 
 
 
306 aa  202  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  45.49 
 
 
288 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  45.81 
 
 
304 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.64 
 
 
260 aa  202  6e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
261 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  45.42 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  49.08 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  41.6 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.93 
 
 
278 aa  199  3e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  44.05 
 
 
278 aa  199  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  44.4 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  41.57 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
260 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  41.96 
 
 
286 aa  199  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  42.74 
 
 
283 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  40.87 
 
 
263 aa  198  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  44.09 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  46.15 
 
 
274 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.02 
 
 
292 aa  198  9e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1428  ABC transporter related  42.58 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  40.7 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  43.67 
 
 
262 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.6 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.6 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  40.87 
 
 
283 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  42.02 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  39.36 
 
 
258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  43.1 
 
 
307 aa  196  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  44.69 
 
 
282 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  40.08 
 
 
263 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.6 
 
 
252 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  47.44 
 
 
285 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  42.35 
 
 
262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
308 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  44.87 
 
 
276 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.26 
 
 
264 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2599  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.31 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3518  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  44.31 
 
 
285 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  41.98 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.72 
 
 
280 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4186  ABC transporter related  44.31 
 
 
273 aa  194  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.431014 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1472  ABC transporter related  41.2 
 
 
292 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211771  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.62 
 
 
330 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  45.81 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  45.81 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  45.81 
 
 
303 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0059  ABC transporter related  39.43 
 
 
257 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  41.38 
 
 
259 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
276 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  46.26 
 
 
281 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0285  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
267 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.120651  hitchhiker  0.0000760001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2563  ABC-transport protein, ATP-binding protein  46.67 
 
 
288 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.25889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.06 
 
 
264 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  40.6 
 
 
261 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>