More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4664 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  82.85 
 
 		 274 aa  472  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  78.44 
 
 		 324 aa  442  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  59.93 
 
 		 267 aa  319  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  56.09 
 
 		 266 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  57.42 
 
 		 276 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  57.83 
 
 		 267 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  55.51 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  55.13 
 
 		 266 aa  288  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  54.61 
 
 		 269 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  57.03 
 
 		 252 aa  285  8e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  54.51 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  53.57 
 
 		 252 aa  281  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  58.7 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  54.17 
 
 		 271 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  55.24 
 
 		 270 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  55.38 
 
 		 267 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  51.85 
 
 		 282 aa  267  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  51.64 
 
 		 284 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  51.17 
 
 		 261 aa  264  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  54.8 
 
 		 268 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  51.2 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  53.57 
 
 		 257 aa  255  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  49.24 
 
 		 284 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  49.21 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  47.64 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  47.24 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  47.6 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  47.24 
 
 		 299 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3413  ATP-binding protein of ABC transporter  48.62 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.24016 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  51.14 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  48.16 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  42.75 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.56 
 
 		 254 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.67 
 
 		 261 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  44.4 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.49 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17270  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.12 
 
 		 274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.528564 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.15 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.36 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.24 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  44.31 
 
 		 263 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  48.39 
 
 		 274 aa  208  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  41.13 
 
 		 276 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  44.86 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  44.86 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  51.49 
 
 		 284 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  41.7 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4331  alkanesulfonate ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44 
 
 		 271 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  49.77 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.93 
 
 		 254 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  43.36 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  43.15 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  42.91 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  49.07 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  45.76 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3570  ABC transporter related  47.03 
 
 		 265 aa  202  3e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.476626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.51 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.5 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3561  ABC transporter related  47.84 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.135479  normal  0.934019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.08 
 
 		 281 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.98 
 
 		 254 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  46.38 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  46.5 
 
 		 258 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  45.54 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  43.59 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  43.08 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  48.5 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.95 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.76 
 
 		 283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  47.03 
 
 		 261 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  42.97 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  44.54 
 
 		 287 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  47.93 
 
 		 253 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.29 
 
 		 265 aa  198  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  42.28 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  41 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  43.08 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.26 
 
 		 260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.34 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  48.42 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  46.09 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.88 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  46.67 
 
 		 282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  49.53 
 
 		 258 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7645  putative sulfonate ABC transporter, ATP binding protein  42.08 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0412308  normal  0.633643 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  44.68 
 
 		 263 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  42.63 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  44.54 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  48.18 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>