More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4759 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  60.54 
 
 		 299 aa  325  7e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  60.61 
 
 		 306 aa  325  7e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  60.23 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 		 284 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  56.52 
 
 		 277 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  53.99 
 
 		 282 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  53.21 
 
 		 276 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  55.6 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  55.02 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  54.22 
 
 		 267 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  51.22 
 
 		 252 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3146  ABC transporter related  54.15 
 
 		 266 aa  266  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  51.31 
 
 		 267 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  52.06 
 
 		 271 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  51.15 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5133  ABC transporter related  51.19 
 
 		 266 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  51.76 
 
 		 270 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0892  ABC transporter related  53.88 
 
 		 252 aa  253  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0967243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  51.63 
 
 		 268 aa  251  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1383  ABC transporter related  52.27 
 
 		 269 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.181644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  52.74 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  48.46 
 
 		 274 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  49.4 
 
 		 246 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  47.25 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  49.4 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1090  ABC transporter related  49.2 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  50.84 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3141  ABC transporter-related protein  48.32 
 
 		 233 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0745233  normal  0.0402056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  49.6 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.59 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  51.07 
 
 		 264 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.09 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  47.2 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  47.2 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  47.33 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  50 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  48.35 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  47.2 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 268 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.45 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  47.76 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  51.15 
 
 		 257 aa  219  5e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.36 
 
 		 261 aa  218  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  45.53 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  50.8 
 
 		 284 aa  217  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 		 281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2967  ABC transporter-related protein  45.87 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0379202  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  48.31 
 
 		 283 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  46.1 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  50.4 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50 
 
 		 278 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0807  ABC transporter related  44.53 
 
 		 269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.455697  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.67 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.75 
 
 		 260 aa  212  5.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2280  ABC transporter related  46.33 
 
 		 257 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.16771  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  48.25 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  45.61 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.46 
 
 		 259 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  47.92 
 
 		 262 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  49.77 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.7 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  50.45 
 
 		 246 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.48 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1045  ABC transporter related  44.63 
 
 		 259 aa  209  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.162928  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.37 
 
 		 306 aa  208  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  43.2 
 
 		 265 aa  208  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  45.83 
 
 		 263 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  47.18 
 
 		 333 aa  208  9e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 291 aa  208  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.4 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  44.11 
 
 		 311 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.13 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.03 
 
 		 283 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.8 
 
 		 278 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  47.08 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  46.06 
 
 		 261 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4164  ABC transporter related  47.26 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.143983  normal  0.780966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  49.34 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  46.28 
 
 		 261 aa  206  5e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0156  ABC transporter related  43.02 
 
 		 260 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  49.3 
 
 		 289 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  43.8 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  46.03 
 
 		 255 aa  205  8e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.24 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.35 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  50.23 
 
 		 330 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.16 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  46.32 
 
 		 278 aa  204  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  43.98 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  48.48 
 
 		 278 aa  203  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  47.44 
 
 		 259 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  47.27 
 
 		 255 aa  202  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.02 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  42.7 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  42.8 
 
 		 284 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  42.59 
 
 		 265 aa  202  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  47.21 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>