More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1489 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  567  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  76.82 
 
 
289 aa  441  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  52.92 
 
 
259 aa  251  8.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.8 
 
 
275 aa  248  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  53.16 
 
 
259 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  49.21 
 
 
284 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  51.04 
 
 
267 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4509  ABC transporter related  50 
 
 
267 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.93 
 
 
271 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  46.83 
 
 
271 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.22 
 
 
271 aa  234  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  46.27 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  47.52 
 
 
271 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  44.18 
 
 
274 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  47.98 
 
 
289 aa  233  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  45.21 
 
 
262 aa  229  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
254 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  47.97 
 
 
271 aa  229  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  45.6 
 
 
264 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  46.12 
 
 
272 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  47.54 
 
 
284 aa  227  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  47.95 
 
 
263 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  45.6 
 
 
278 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  51.61 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  49.78 
 
 
287 aa  225  8e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  49.78 
 
 
281 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  46.62 
 
 
271 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  44.4 
 
 
275 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  46.62 
 
 
271 aa  223  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  42.97 
 
 
260 aa  223  3e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  45.11 
 
 
307 aa  223  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  46.46 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
278 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  47.3 
 
 
263 aa  221  8e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2836  ABC transporter related  44.44 
 
 
272 aa  221  8e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.840356  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0398  ABC transporter related  49.36 
 
 
259 aa  221  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.698259 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  45.45 
 
 
262 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  48.32 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3611  ABC transporter related  43.35 
 
 
275 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1094  ABC transporter related  46.69 
 
 
299 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0108861  normal  0.165383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 
281 aa  219  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  42 
 
 
258 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  45.73 
 
 
304 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 
278 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  49.05 
 
 
253 aa  219  6e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  50.43 
 
 
286 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2275  ABC transporter related  43.08 
 
 
264 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0996963 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  45.85 
 
 
251 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  45.02 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  45.71 
 
 
254 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2039  ABC transporter related  45.91 
 
 
306 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.768155 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 
272 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1979  ABC transporter related  46.49 
 
 
258 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000563857  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  45.53 
 
 
273 aa  217  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1956  ABC transporter related  46.9 
 
 
272 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.95 
 
 
304 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3352  ABC transporter related  50 
 
 
261 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  46.9 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.41 
 
 
261 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.9 
 
 
269 aa  215  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.03 
 
 
264 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0572  ABC transporter related  43.95 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  46.01 
 
 
304 aa  215  8e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  47.79 
 
 
293 aa  214  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2105  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  45.95 
 
 
289 aa  214  9e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  47.79 
 
 
293 aa  214  9e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  45.75 
 
 
264 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  45.78 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  50.45 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2014  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  45.93 
 
 
259 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  51.13 
 
 
280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  47.73 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2857  ABC transporter-related protein  43.32 
 
 
259 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.99142  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  43.55 
 
 
303 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1720  ABC transporter related  45.53 
 
 
304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  49.3 
 
 
288 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2718  ABC transporter related  43.09 
 
 
259 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  45.78 
 
 
254 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  41.02 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  50.47 
 
 
276 aa  212  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.58 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.42 
 
 
279 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.96 
 
 
267 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  43.15 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.68 
 
 
283 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
260 aa  212  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  43.15 
 
 
303 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3643  ABC transporter related  47.58 
 
 
259 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.31 
 
 
276 aa  211  7.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.78 
 
 
297 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.53 
 
 
266 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.4 
 
 
282 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  45.38 
 
 
267 aa  211  1e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 
261 aa  211  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4567  ABC transporter related  47.64 
 
 
260 aa  211  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  47.35 
 
 
269 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2080  ABC transporter related  44.86 
 
 
270 aa  211  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.8 
 
 
306 aa  211  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>