More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2702 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2702  ABC transporter related  100 
 
 
263 aa  538  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.08 
 
 
257 aa  302  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  54.98 
 
 
276 aa  248  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  50.42 
 
 
278 aa  245  4e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  48.03 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.61 
 
 
259 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 
281 aa  238  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.38 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  50.21 
 
 
257 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  54.67 
 
 
275 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  47.6 
 
 
304 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  49.79 
 
 
303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  49.79 
 
 
303 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  48.37 
 
 
254 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  49.79 
 
 
303 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.2 
 
 
304 aa  228  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1489  ABC transporter related  47.95 
 
 
283 aa  228  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  48.4 
 
 
307 aa  227  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3906  ABC transporter related  52.29 
 
 
315 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.118447  normal  0.091795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
264 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.97 
 
 
274 aa  225  6e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
260 aa  224  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  46.31 
 
 
262 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7649  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  48.33 
 
 
289 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1857  ABC transporter related  48.18 
 
 
304 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4356  ABC transporter related  50 
 
 
275 aa  223  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0157567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  43.31 
 
 
284 aa  222  4e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  44.88 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  51.77 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  46.56 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  50.43 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  48.02 
 
 
261 aa  218  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6544  putative ABC transporter  52.31 
 
 
259 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  44.36 
 
 
267 aa  218  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
308 aa  217  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 
271 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  50.94 
 
 
287 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  45.27 
 
 
271 aa  216  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  44.22 
 
 
258 aa  217  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 
260 aa  216  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  48.02 
 
 
271 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.16 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2628  ABC transporter related  43.3 
 
 
275 aa  215  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  46.09 
 
 
311 aa  215  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  44.78 
 
 
269 aa  215  5e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.72 
 
 
289 aa  215  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.83 
 
 
269 aa  214  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  45.45 
 
 
254 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.81 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  48.91 
 
 
282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  46 
 
 
306 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  46.96 
 
 
297 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  44.62 
 
 
286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1645  ABC transporter related  45.56 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3148  ABC transporter related  45.71 
 
 
266 aa  212  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
278 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  47.22 
 
 
272 aa  211  9e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0962  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.15 
 
 
304 aa  211  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.439268 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  44.86 
 
 
311 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.38 
 
 
254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  44.53 
 
 
271 aa  210  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6155  ABC transporter related  44.66 
 
 
286 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300039  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  49.77 
 
 
276 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  45.61 
 
 
253 aa  210  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2675  putative ABC transporter, ATP-binding protein  50.98 
 
 
281 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658028  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  45.37 
 
 
254 aa  209  3e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7587  ABC transporter related protein  47.7 
 
 
258 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.439074  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  46.88 
 
 
266 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  42.97 
 
 
263 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6051  ABC transporter related  48.21 
 
 
262 aa  209  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1187  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 
260 aa  208  6e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0360138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
276 aa  208  6e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
261 aa  208  6e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.22 
 
 
278 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2086  ABC transporter related  48.32 
 
 
291 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7933  ABC transporter related  44.05 
 
 
258 aa  207  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.76 
 
 
283 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  46.53 
 
 
263 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1788  ABC transporter related  43.15 
 
 
303 aa  207  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0467  ABC transporter related  46.59 
 
 
274 aa  207  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  43.78 
 
 
252 aa  207  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  44.9 
 
 
288 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1481  ABC transporter related  48.23 
 
 
283 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.05 
 
 
251 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  48.58 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4184  ABC transporter related  48.55 
 
 
283 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3670  ABC transporter related  51.82 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.206821  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3345  ABC transporter related  51.82 
 
 
293 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  45.92 
 
 
258 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  47.79 
 
 
272 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1262  ABC transporter related  41.27 
 
 
259 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0287206  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  45.82 
 
 
262 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  48.58 
 
 
293 aa  206  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  46.67 
 
 
267 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  47.75 
 
 
257 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4138  ABC transporter related  45.68 
 
 
311 aa  205  5e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.78 
 
 
280 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02110  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  46.59 
 
 
311 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>